| 羊草种子萌发相关基因的筛选及表达分析 |
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| 引用本文： | 刘书,刘盼盼,杨伟光,齐冬梅,李晓霞,刘公社.羊草种子萌发相关基因的筛选及表达分析[J].草业学报,2018,27(11):58-66. |
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| 作者姓名： | 刘书 刘盼盼 杨伟光 齐冬梅 李晓霞 刘公社 |
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| 作者单位： | 1.中国科学院植物研究所,北京 100093;2.中国科学院大学,北京 100049;3.黑龙江省畜牧研究所,黑龙江 齐齐哈尔 161005 |
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| 基金项目： | 牧草种质资源保护项目(2130135)和973项目(2014CB138704)资助 |
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| 摘 要： | 前期实验表明,变温处理(28 ℃ 12 h/16 ℃ 12 h)可显著提高羊草种子的萌发率,且羊草种子萌发中的第1天是接受变温信号的关键时期。以此为研究基础,结合羊草种子变温萌发的转录组测序数据,针对羊草种子萌发初期对变温处理的响应筛选出与种子萌发、休眠及低温相关的基因24个,利用测序结果中这些基因的RPKM值制作基因表达热图并分析其表达差异。以萌发率高、低的两种羊草种质的种子为材料,对24个基因在恒温12 h(28 ℃)和变温1 d(28 ℃ 12 h/16 ℃ 12 h)萌发处理中的表达分别进行了定量分析。结果表明,与恒温对照相比,变温处理12 h后,表达明显上调的基因有SAIN1,PP2C62,EXPB3,EXPB4,GA3ox,EXPA2和EXPA7,而表达明显下调的基因有bHLH49,GID1,ABI8,Chi1,11833,CBF3,NAC2,PP2C72,SAIN2和5423。通过进一步分析相关基因在高、低萌发率两个种质中表达的差异,筛选出其中可能与羊草种子萌发相关的基因有几丁质酶基因Chi1,转录因子基因CBF3,羊草新基因5423,赤霉素合成基因GA3ox,细胞松弛素蛋白基因EXPB4和羊草新基因SAIN1,将为下一步阐明羊草种子萌发的分子作用机理奠定基础。
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| 关 键 词： | 羊草 种子萌发 变温 基因表达 |
| 收稿时间： | 2017-12-13 |
| 修稿时间： | 2018-03-02 |
The identification and expression analysis of genes related to seed germination in Leymus chinensis |
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| LIU Shu,LIU Pan-pan,YANG Wei-guang,QI Dong-mei,LI Xiao-xia,LIU Gong-she.The identification and expression analysis of genes related to seed germination in Leymus chinensis[J].Acta Prataculturae Sinica,2018,27(11):58-66. |
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| Authors: | LIU Shu LIU Pan-pan YANG Wei-guang QI Dong-mei LI Xiao-xia LIU Gong-she |
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| Institution: | 1.Institute of Botany, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100093, China;2.University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China;3.Institute of Animal Sciences in Heilongjiang Province, Qiqihar 161005, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Leymus chinensis seed germination variable temperature treatment gene expression |
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