| 正交设计优化假俭草SRAP-PCR反应体系及引物筛选 |
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| 引用本文： | 郑轶琦,王志勇,郭海林,薛丹丹,刘建秀.正交设计优化假俭草SRAP-PCR反应体系及引物筛选[J].草业学报,2008,17(4). |
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| 作者姓名： | 郑轶琦 王志勇 郭海林 薛丹丹 刘建秀 |
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| 作者单位： | 南京农业大学园艺学院,江苏,南京,210095;江苏省中国科学院植物研究所南京中山植物园,江苏,南京,210014;江苏省中国科学院植物研究所南京中山植物园,江苏,南京,210014 |
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| 摘 要： | 以假俭草叶片DNA为模板,采用正交试验设计,以Mg2 、dNTP、引物和Taq DNA聚合酶4种因素3个水平,对假俭草SRAP反应体系进行研究,并比较了不同浓度模板DNA对扩增效果的影响,建立了假俭草的SRAP最佳反应体系.结果表明,假俭草SRAP-PCR最佳反应体系为:2 μL 10譖CR buffer、60 ng模板DNA、Mg2 1.50 mmol/L、dNTP 260 μmol/L、引物0.25 μmol/L、Taq DNA聚合酶0.5 U,总体积为20 μL.各因素对扩增反应结果均有不同影响,其中以Mg2 浓度影响最大,Taq DNA聚合酶的影响最小.运用该体系对4份假俭草种源进行验证,证明该体系稳定可靠,并从45个SRAP引物组合中筛选出扩增条带清晰、多态性丰富的26个引物组合.这一体系的建立及多态性引物组合的筛选为今后利用SRAP标记技术进行假俭草分子遗传学研究提供了科学依据.
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| 关 键 词： | 假俭草 SRAP标记 正交试验设计 体系优化 引物筛选 |
Optimization of SRAP-PCR system on centipedegrass (Eremochloa ophiuroides) using orthogooal design and selection of primers |
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| ZHENG Yi-qi,WANG Zhi-yong,GUO Hai-lin,XUE Dan-dan,LIU Jian-xiu.Optimization of SRAP-PCR system on centipedegrass (Eremochloa ophiuroides) using orthogooal design and selection of primers[J].Acta Prataculturae Sinica,2008,17(4). |
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| Authors: | ZHENG Yi-qi WANG Zhi-yong GUO Hai-lin XUE Dan-dan LIU Jian-xiu |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Eremochloa ophiuroides SRAP markers orthogonal design optimization of system selection of primers |
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