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基于RNA-Seq数据分析环格列酮和胰岛素诱导延边黄牛前脂肪细胞分化的差异表达基因
引用本文:郭盼盼,金鑫,孙建富,李香子,尹云厚,严昌国.基于RNA-Seq数据分析环格列酮和胰岛素诱导延边黄牛前脂肪细胞分化的差异表达基因[J].中国畜牧兽医,2021,48(7):2358-2368.
作者姓名:郭盼盼  金鑫  孙建富  李香子  尹云厚  严昌国
作者单位:1. 延边大学农学院动物科学系, 延吉 133002;2. 贵州民族大学, 贵阳 550025
基金项目:国家重点研发计划项目(2018YFD0501702);贵州省科技计划项目(黔科合基础[2018]1073)
摘    要:试验旨在探讨过氧化物酶体增殖物激活受体γ(peroxisome proliferators-activated receptors,PPARγ)激动因子(环格列酮)和胰岛素对延边黄牛前脂肪细胞脂质代谢的影响及可能的调控机制。试验分为对照组(CON,5% FBS)、胰岛素处理组(I组,5% FBS+10 mg/L胰岛素)、环格列酮处理组(C组,5% FBS+10 mg/L环格列酮)、胰岛素+环格列酮处理组(IC组,5% FBS+10 mg/L胰岛素+10 mg/L环格列酮)。各组处理144 h,通过RNA-Seq技术对其进行转录本测序,差异表达基因进行GO功能注释和KEGG富集分析。差异表达基因分析结果显示,与对照组相比,IC组差异表达基因数量为1 764个,比I和C组分别多276和569个,3个试验组间共有371个差异基因;IC组上调基因数量为974个,分别比I和C组多140和249个,IC组下调基因为790个,I和C组下调基因分别为654和470个。差异基因的GO分析表明,各处理组的差异基因参与了细胞过程、代谢过程以及生物过程的调节;在分子功能上,主要是分子功能调节剂、转运活性、转录调节活性等;在细胞成分上,大多数差异基因被富集到细胞器、细胞膜及胞外区等。KEGG通路分析发现,差异表达基因主要富集在FoxO、PPAR、TGF-β、p53等信号通路。综上所述,胰岛素和环格列酮单独处理与二者共同处理对延边黄牛前脂肪细胞分化的调控机制有所差别,其中二者共同处理对分化的促进作用更加明显。本研究结果为研究环格列酮与胰岛素在调节脂肪生成中的功能和分子机制提供了依据。

关 键 词:RNA-Seq  胰岛素  环格列酮  延边黄牛  前脂肪细胞  
收稿时间:2020-11-13

Analysis of Differentially Expressed Genes in Differentiation of Yanbian Yellow Cattle Preadipocytes Induced by Cycloglitazone and Insulin Based on RNA-Seq Data
GUO Panpan,JIN Xin,SUN Jianfu,LI Xiangzi,YIN Yunhou,YAN Changguo.Analysis of Differentially Expressed Genes in Differentiation of Yanbian Yellow Cattle Preadipocytes Induced by Cycloglitazone and Insulin Based on RNA-Seq Data[J].China Animal Husbandry & Veterinary Medicine,2021,48(7):2358-2368.
Authors:GUO Panpan  JIN Xin  SUN Jianfu  LI Xiangzi  YIN Yunhou  YAN Changguo
Institution:1. Department of Animal Science, Yanbian University, Yanji 133002, China;2. Guizhou Minzu University, Guiyang 550025, China
Abstract:
Keywords:RNA-Seq  insulin  ciglirtazone  Yanbian Yellow cattle  preadipocytes  
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