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| 基于RNA-Seq技术挖掘绵羊背最长肌肉质性状相关基因 | |
| 引用本文： | 王位,付绍印,何小龙,王艳欣,王月星,王标,刘斌,刘永斌,张文广.基于RNA-Seq技术挖掘绵羊背最长肌肉质性状相关基因[J].中国畜牧兽医,2018,45(1):122-130. |
| 作者姓名： | 王位 付绍印 何小龙 王艳欣 王月星 王标 刘斌 刘永斌 张文广 |
| 作者单位： | 1. 内蒙古农业大学动物科学学院, 呼和浩特 010018; 2. 动物遗传育种与繁殖内蒙古自治区重点实验室, 呼和浩特 010018; 3. 内蒙古自治区农牧业科学院, 呼和浩特 010031; 4. 内蒙古ATCG生物信息研究所, 呼和浩特 010020; 5. 内蒙古犇牛科技有限公司, 呼和浩特 010020 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（31360542）；内蒙古自治区农牧业科学院青年创新基金（2015QNJJM04）；国家肉羊产业技术体系建设项目（CARS-39） |
| 摘 要： | 试验通过对小尾寒羊与巴美肉羊背最长肌进行转录组分析，旨在挖掘影响两种绵羊肉质性状的关键基因。分别选取小尾寒羊和巴美肉羊各3只，利用转录组高通量测序（RNA-Seq）技术对其背最长肌转录组文库进行测序，利用生物信息学对测序结果进行分析，筛选影响两者肉质相关的候选基因。结果发现，6个样品测序数据经质量控制后共得到120 Gb的有效数据，共筛选出333个差异基因，其中上调基因有82个，下调基因有251个。GO功能富集与KEGG Pathway显著性富集分析结果共筛选了6个与肉质性状相关的候选基因：PDK4、MYF6、PPARGC1A、SLCO4A1、FABP4、LEP。试验通过对比小尾寒羊与巴美肉羊背最长肌转录组数据，筛选影响肉质性状的候选基因，丰富了绵羊基因组信息，为进一步阐述不同品种绵羊肉质性状分子机理奠定了基础。 |
| 关 键 词： | RNA-Seq 肉质性状 转录组 小尾寒羊 巴美肉羊 背最长肌 |
| 收稿时间： | 2017-06-28 |
Excavation of Meat Quality Related Genes in Longissimus Dorsi of Sheep by RNA-Seq |
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| WANG Wei,FU Shaoyin,HE Xiaolong,WANG Yanxin,WANG Yuexing,WANG Biao,LIU Bin,LIU Yongbin,ZHANG Wenguang.Excavation of Meat Quality Related Genes in Longissimus Dorsi of Sheep by RNA-Seq[J].China Animal Husbandry & Veterinary Medicine,2018,45(1):122-130. | |
| Authors: | WANG Wei FU Shaoyin HE Xiaolong WANG Yanxin WANG Yuexing WANG Biao LIU Bin LIU Yongbin ZHANG Wenguang |
| Institution: | 1. College of Animal Science, Inner Mongolia Agricultural University, Hohhot 010018, China; 2. Key Laboratory of Animal Science, Breeding and Reproduction of the Inner Mongolia Autonomous Region, Hohhot 010018, China; 3. Inner Mongolia Academy of Agricultural & Animal Husbandry Science, Hohhot 010031, China; 4. Institute of ATCG, Nei Mongolia Bio-information, Hohhot 010020, China; 5. Nei Mongol BioNew Technology Co., Ltd., Hohhot 010020, China |
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| Keywords: | |
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