牦牛Myf6基因克隆及生物信息学分析

本试验旨在克隆牦牛Myf6基因，进行生物信息学分析并探究其在牦牛不同时期的表达情况。以青海雪多牦牛为研究对象，通过设计引物对其Myf6基因CDS区进行克隆测序，运用生物信息学软件对其功能结构进行预测研究。结果显示，牦牛Myf6基因含有一个大小为729 bp的开放阅读框（ORF），编码242个氨基酸。同源性比对和进化树分析结果表明，牦牛Myf6氨基酸序列与普通牛、绵羊亲缘性最近。对Myf6蛋白理化性质进行预测分析得到其结构式为C₁₁₆₇H₁₈₇₀N₃₃₆O₃₇₂S₁₃，理论等电点为5.64，其中丝氨酸含量最高，其次是亮氨酸、谷氨酸、脯氨酸和精氨酸；其疏水平均值为-0.586，亲水性最强为-2.467，疏水性最强为1.511，为亲水性、可溶性蛋白；有可形成卷曲螺旋部位；磷酸化位点预测其有26个丝氨酸激酶，10个苏氨酸激酶，5个酪氨酸激酶；亚细胞定位分析其编码产物在细胞核中分布最多（73.9%），其次为细胞骨架（13.0%）、细胞质（4.3%）、高尔基体（4.3%）、分泌系统小泡（4.3%）。蛋白质二级结构主要由无规则卷曲（49.17%）组成，其次是α-螺旋（33.47%）、延伸连（11.57%）及β-折叠（5.79%）。蛋白功能分析显示其生长因子功能几率较大（7.694），其次为转录调节作用，预测其作为一种生长因子参与机体生物学调控。实时荧光定量PCR结果显示，Myf6基因在胎牛、6月龄、4~5岁牦牛背最长肌中均有表达，且在6月龄的表达量显著高于胎牛和4~5岁牦牛（P<0.05）。上述结果为研究牦牛Myf6生肌因子提供了重要的研究数据，为改良牦牛经济性状提供了参考。

Cloning and Bioinformatics Analysis of Myf6 Gene in Yak