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鸳鸯mtDNA D-loop序列分析
引用本文:王禄超,刘若余,林家栋,主性,田兴贵,陈眷华,徐祖军.鸳鸯mtDNA D-loop序列分析[J].中国畜牧兽医,2011,38(9):71-73.
作者姓名:王禄超  刘若余  林家栋  主性  田兴贵  陈眷华  徐祖军
作者单位:1. 高原山地动物遗传育种与繁殖省部共建教育部重点实验室,贵州大学动物科学学院,贵州贵阳550025
2. 贵州省石阡县林业局,贵州石阡,555100
基金项目:石阡县鸳鸯资源保护研究
摘    要:采用PCR和直接测序方法测定鸳鸯线粒体DNA(mtDNA)控制区全序列,与GenBank上已知序列相比较分析mtDNA D-loop 3个区的序列变异。结果发现,鸳鸯mtDNA控制区序列长1035 bp;与欧洲鸳鸯相比,鸳鸯(样品采集来自贵州省石阡县)mtDNA控制区共存在25处转换、12处颠换、2处插入和12处缺失;两种鸳鸯之间mtDNA控制区Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ区的序列变异率分别为14.5%、0.64%和0.8%,Ⅰ区的变异速率最快;mtDNA控制区的A、C、T、G碱基含量分别是26.6%、16.0%、26.6%和30.8%,A+T含量稍高于C+G含量,G含量最高,符合序列组成的碱基偏倚性。与其他鸭科物种进行了mtDNA控制区序列一致性的比较,结果均高于80%。

关 键 词:鸳鸯  mtDNA控制区  序列  变异  
收稿时间:2010-12-23

Sequence Analysis of mtDNA D-loop from Aix Galericulata
WANG Lu-chao,LIU Ruo-yu,LIN Jia-dong,ZHU Xing,TIAN Xing-gui,CHEN Juan-hua,XU Zu-jun.Sequence Analysis of mtDNA D-loop from Aix Galericulata[J].China Animal Husbandry & Veterinary Medicine,2011,38(9):71-73.
Authors:WANG Lu-chao  LIU Ruo-yu  LIN Jia-dong  ZHU Xing  TIAN Xing-gui  CHEN Juan-hua  XU Zu-jun
Institution:1. Key Laboratory of Animal Genetics, Breeding and Reproduction in the Plateau Mountainous Region, Ministry of Education, Guizhou University, Guiyang 550025, China;2. Forest Bureau of Shiqian County, Shiqian 555100, China
Abstract:Using PCR and direct sequencing to analysis the mitochondrial DNA(mtDNA) control region of Aix galericulata. Compare with reported sequence in GenBank to analysis sequence variation about three districts of mtDNA D-loop.The Aix galericulata(samples collected from Shiqian county in Guizhou province) mtDNA control region was 1035 bp.Compare with Foreign mandarin duck,there were 25 transformations,12 transeversions,2 insertions and 12 deletions in mtDNA control region.The mutation rate of mtDNA control region'...
Keywords:Aix galericulata  mitochondrial DNA(mtDNA) control region  sequence  variation  
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