| 利用EST库资源克隆家蚕腺苷酸转移酶基因 |
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| 引用本文： | 陈大福,牛宝龙,翁宏飚,孟智启,吕顺霖.利用EST库资源克隆家蚕腺苷酸转移酶基因[J].蚕业科学,2004,30(2):151-156. |
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| 作者姓名： | 陈大福 牛宝龙 翁宏飚 孟智启 吕顺霖 |
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| 作者单位： | 浙江大学动物科学学院,杭州,310029;福建农林大学蜂学学院;浙江省农业科学院蚕桑研究所;浙江大学动物科学学院,杭州,310029 |
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| 摘 要： | 根据物种间同源基因相对保守的特点 ,利用生物信息学方法以果蝇 (Drosophilamelanogaster)腺苷酸转移酶基因 (adeninenucleotidetranslocase,ant)cDNA序列作为模板 ,对家蚕 (Bombyxmori)EST数据库进行同源检索筛选 ,克隆了家蚕腺苷酸转移酶基因的cDNA序列 (GenBank登录号为AY2 2 70 0 0 ) ,全长为 1936bp ,并经RT PCR克隆、序列分析验证 ,结果与电子克隆序列完全一致。该cDNA序列具有完整的开放阅读框架 (ORF ,2 0 7～ 110 9bp) ,推测编码蛋白为 30 0个氨基酸 ,通过与烟草天蛾 (Manducasexta)、蜜蜂 (Apismellifera)、绿蝇 (Luciliacuprina)、果蝇、蚊子(Anophelesgambiae)等昆虫的腺苷酸转移酶蛋白序列比较 ,发现该基因具有高度的保守性。表明根据物种间同源基因序列 ,对跨物种间EST数据库进行同源检索筛选、拼接 ,是基因克隆的一条有效途径。
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| 关 键 词： | 家蚕 EST数据库 RT-PCR 腺苷酸转移酶 |
| 文章编号： | 0257-4799(2004)02-0151-06 |
| 修稿时间： | 2004年3月3日 |
Cloning of Adenine Nucleotide Translocase Gene From Bombyx mori Based on EST Database |
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| Abstract: | According to the relative conservation of homologous gene, a bioinformatics strategy is applied to clone a novel silkworm (Bombyx mori) adenine nucleotide translocase gene (ant) by blasting search of EST database with homologous gene cDNA of Drosophila melanogaster and identified. The full length silkworm ant cDNA of 1 963 bp encodes adenine nucleotide translocase (ANT) of 300 amino acids (aa), which is very conserved in Apis mellifera, Lucilia cuprina, D. melanogaster, Anopheles gambiae and Manduca sexta. The results revealed that it is a convenient technique for cloning novel gene by searching EST database with homologous gene of model living things such as the fruit fly. |
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| Keywords: | Bombyx moriEST databaseRT-PCRAdenine nucleotide translocase |
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