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基于ISSR标记初选格鲁桑类型桑树核心种质
引用本文:张林,陈俊百,黄勇,沈兴家,刘利,赵卫国,强胜. 基于ISSR标记初选格鲁桑类型桑树核心种质[J]. 蚕业科学, 2011, 37(3): 380-388
作者姓名:张林  陈俊百  黄勇  沈兴家  刘利  赵卫国  强胜
作者单位:南京农业大学生命科学学院杂草研究室,南京,210095;中国农业科学院蚕业研究所,江苏镇江,212018;江苏科技大学,江苏镇江,212003;江苏科技大学,江苏镇江,212003;江苏科技大学,江苏镇江,212003;农业部蚕桑遗传改良重点开放实验室,江苏镇江,212018;中国农业科学院蚕业研究所,江苏镇江,212018;农业部蚕桑遗传改良重点开放实验室,江苏镇江,212018;中国农业科学院蚕业研究所,江苏镇江,212018;南京农业大学生命科学学院杂草研究室,南京,210095
基金项目:农业部作物种质资源保护项目(No.NB2010-2130135-24)
摘    要:核心种质可以用最少份数的种质资源代表该物种及生态类型的遗传多样性。以收集自我国黄土高原的73份格鲁桑类型桑树种质资源为材料,利用15个ISSR引物共扩增出129条带,其中多样性条带为115条,多态性比率为89.15%。根据ISSR分子标记聚类结果和树型图,利用逐步聚类随机取样法和属性约简启发式算法对73份种质资源进行核心种质构建研究,2种方法分别初选出21份和16份格鲁桑类型桑树核心种质,核心种质样本的比率分别为28.77%、21.92%。利用统计软件SPSS 13.0,结合分子标记多态性位点数、多态性位点百分率、观测等位基因数、有效等位基因数、Nei's遗传多样性指数和Shannon's信息指数对2组核心种质的遗传多样性进行评价和t检验,结果显示:采用2种方法初选出的21份和16份格鲁桑核心种质都能很好地保存初始群体的遗传多样性和结构,但采用属性约简启发式算法所得16份核心种质的代表性要优于采用逐步聚类随机取样法所得的21份核心种质。最终确定以属性约简启发式算法初选的16份样本作为格鲁桑类型桑树核心种质。

关 键 词:桑树  核心种质  格鲁桑  遗传多样性  ISSR标记

Screening of Core Germplasms of Gelu Ecotype Mulberry Based on ISSR Marker
ZHANG Lin,CHEN Jun-Bai,HUANG Yong,SHEN Xing-Jia,LIU Li,ZHAO Wei-Guo,QIANG Sheng. Screening of Core Germplasms of Gelu Ecotype Mulberry Based on ISSR Marker[J]. Acta Sericologica Sinica, 2011, 37(3): 380-388
Authors:ZHANG Lin  CHEN Jun-Bai  HUANG Yong  SHEN Xing-Jia  LIU Li  ZHAO Wei-Guo  QIANG Sheng
Affiliation:ZHANG Lin1,2,3 CHEN Jun-Bai3 HUANG Yong3,4 SHEN Xing-Jia2,4 LIU Li2 ZHAO Wei-Guo2 QIANG Sheng1*(1Weed Research Laboratory,Life Sciences College of Nanjing Agricultural University,Nanjing 210095,China,2The Sericultural Research Institute,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Zhenjiang Jiangsu 212018,3Jiangsu University of Science and Technology,Zhenjiang Jiangsu 212003,4The Key Laboratory of Genetic Improvement of Silkworm and Mulberry,Ministry of Agriculture,China)
Abstract:Core germplasms are germplasm resources with the minimum number to represent a specific species and its ecotypes.Genetic diversity of 73 Gelu ecotype mulberry germplasm resources collected from loess plateau of China was analyzed using 15 ISSR primers.As a whole,129 bands were amplified,among which 115 were polymorphic,with a diversification rate of 89.15%.Based on clustering and cladogram of ISSR molecular markers,the stepwise clustering and random sampling method and the modified heuristic parsimony algor...
Keywords:Morus L.  Core collection  Gelu ecotype mulberry  Genetic diversity  ISSR marker  
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