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草莓镶脉病毒外壳蛋白抗原表位预测、克隆、表达及鉴定
引用本文:杨菊梅,马建忠,潘博,李印武.草莓镶脉病毒外壳蛋白抗原表位预测、克隆、表达及鉴定[J].植物保护学报,2018,45(3):439-446.
作者姓名:杨菊梅  马建忠  潘博  李印武
作者单位:兰州理工大学生命科学与工程学院;兰州大学第二医院;甘肃启明星节能科技有限公司
基金项目:甘肃省科技计划项目(1504WKCA020),国家大学生创新创业训练项目(DC2015085),甘肃省横向科技项目(10-2203)
摘    要:为实现草莓镶脉病毒(Strawberry vein banding virus,SVBV)的简单和快速检测,应用生物信息学方法分析了SVBV外壳蛋白的线性抗原表位及其理化性质,以大肠杆菌的优势密码子对所预测的优势抗表原位进行设计并合成,同时进行了最佳异源表达条件优化。结果表明,第218~238位的氨基酸残基序列为SVBV外壳蛋白的优势抗原表位,其编码片段为5-AE。十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis,SDS-PAGE)检测结果表明,重组融合蛋白的分子量约为24.8 kD,与其理论分子量20.5 kD基本一致。异源表达优化的结果表明,当IPTG浓度为0.5 mmol/L、温度为40℃、诱导时间为4 h时,重组融合蛋白的表达量最高,为23.6 mg/L。Western blot结果表明重组融合蛋白能与His多克隆抗体起特异性反应。串联质谱结果表明,5-AE肽段氨基酸残基序列正确。

关 键 词:草莓镶脉病毒  外壳蛋白  抗原表位  原核表达  质谱鉴定
收稿时间:2016/10/9 0:00:00

Prediction, cloning, expression and identification of an epitope of the coat protein of the Strawberry vein banding virus
Yang Jumei,Ma Jianzhong,Pan Bo and Li Yinwu.Prediction, cloning, expression and identification of an epitope of the coat protein of the Strawberry vein banding virus[J].Acta Phytophylacica Sinica,2018,45(3):439-446.
Authors:Yang Jumei  Ma Jianzhong  Pan Bo and Li Yinwu
Institution:College of Life Science and Engineering, Lanzhou University of Technology, Lanzhou 730050, Gansu Province, China;Lanzhou University Second Hospital, Lanzhou 730030, Gansu Province, China,College of Life Science and Engineering, Lanzhou University of Technology, Lanzhou 730050, Gansu Province, China,Gansu Qimingxing Energy-Saving Limited Company, Baiyin 730913, Gansu Province, China and Gansu Qimingxing Energy-Saving Limited Company, Baiyin 730913, Gansu Province, China
Abstract:
Keywords:Strawberry vein banding virus  coat protein  epitope  prokaryotic expression  identification by mass spectrometry
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