亚洲小车蝗型变相关基因的转录组学分析 |
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引用本文: | 郭娜,闫锋,韩海斌,高书晶,董瑞文,胡哲华.亚洲小车蝗型变相关基因的转录组学分析[J].植物保护学报,2021,48(1):136-143. |
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作者姓名: | 郭娜 闫锋 韩海斌 高书晶 董瑞文 胡哲华 |
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作者单位: | 中国农业科学院草原研究所, 呼和浩特 010010;鄂尔多斯市森林病虫害防治检疫站, 内蒙古 鄂尔多斯 017010;乌兰察布盟四子王旗草原站, 内蒙古 乌兰花 011800 |
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基金项目: | 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金(1610332020008),国家科技基础资源调查专项(2019FY100400),内蒙古自治区自然科学基金(2019BS03011) |
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摘 要: | 为揭示亚洲小车蝗Oedaleus asiaticus两型现象转变的分子机制,本研究以亚洲小车蝗3龄蝗蝻为研究对象,对散居型单头饲养的亚洲小车蝗进行高密度群居化胁迫处理,并对处理后型变第1、3、5、7天的蝗蝻取样,利用Illummina Hiseq 4000高通量测序平台对样本转录组进行测序、组装、注释,筛选调控亚洲小车蝗由散居型向群居型转变的相关基因。测序后共获得60502个unigenes,在Nr、KEGG、KOG、SwissPort四大数据库中比对得到有注释信息基因数目分别为27820、21529、14346和15154个,型变过程中差异表达基因数目在第3天时最多,为7478个,第7天时差异表达基因数目最少,为1857个;亚洲小车蝗3龄蝗蝻型变过程差异表达基因的GO功能主要富集于生物过程、细胞组分和分子功能3个部分,高密度环境诱导下亚洲小车蝗3龄蝗蝻型变第1、3、5、7天差异表达基因的数量呈现先增加后减少的趋势,型变第1天时556个差异表达基因显著富集到120条代谢通路上,型变第3天时1133个差异表达基因显著富集到130条代谢通路上,型变第5天时374个差异表达基因显著富集到115条代谢通路上,型变第7天时220个差异表达基因显著富集到98条代谢通路上。
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关 键 词: | 亚洲小车蝗 型变 差异表达基因 高通量测序 |
收稿时间: | 2020/10/25 0:00:00 |
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