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基于基因混池测序技术的小麦条锈菌对三唑酮抗性位点相关分析
引用本文:纪凡,徐三丁,郑少兵,黄丽丽,康振生,詹刚明.基于基因混池测序技术的小麦条锈菌对三唑酮抗性位点相关分析[J].植物保护学报,2021,48(3):610-619.
作者姓名:纪凡  徐三丁  郑少兵  黄丽丽  康振生  詹刚明
作者单位:西北农林科技大学植物保护学院, 旱区作物逆境生物学国家重点实验室, 陕西 杨凌 712100
基金项目:国家重点研发计划(2017YFD0201700,2018YFD0200400),国家自然科学基金(31871918)
摘    要:为探究小麦条锈菌Puccinia striiformis f. sp. tritici对三唑类杀菌剂产生抗药性的相关机理,以小麦条锈菌抗药性菌株YQ324与敏感性菌株贵1-2在转主寄主堆花小檗Berberis aggregata上构建的有性遗传群体为材料,通过离体叶段法对F1代杂交及F2代自交后代的夏孢子群体进行三唑酮敏感性生物学测定,并在F2代夏孢子群体中筛选20株抗药性菌株和20株敏感性菌株分别构建DNA抗、感池。在对抗、感混池进行高通量测序之后,通过质量检测和数据分析得到2个极端混池中的变异信息。根据ΔIndex为1的筛选标准在小麦条锈菌中鉴定出67个与三唑酮抗性显著相关的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点;利用SNPEff软件对这些SNP位点引起氨基酸非同义突变所在的基因序列进行功能注释,最终在pcontig_030上筛选到Pst104E_09436Pst104E_09437这2个基因作为小麦条锈菌对三唑酮抗性相关的候选基因。

关 键 词:小麦条锈病  三唑酮  敏感性测定  混池测序  候选基因
收稿时间:2020/5/14 0:00:00

Identification of triadimefon resistance loci in wheat stripe rust fungus based on gene pool sequencing
Ji Fan,Xu Sanding,Zheng Shaobing,Huang Lili,Kang Zhensheng,Zhan Gangming.Identification of triadimefon resistance loci in wheat stripe rust fungus based on gene pool sequencing[J].Acta Phytophylacica Sinica,2021,48(3):610-619.
Authors:Ji Fan  Xu Sanding  Zheng Shaobing  Huang Lili  Kang Zhensheng  Zhan Gangming
Institution:State Key Laboratory of Crop Stress Biology for Arid Areas, College of Plant Protection, Northwest A&F University, Yangling 712100, Shaanxi Province, China
Abstract:
Keywords:wheat stripe rust fungus  triadimefon  sensitivity determination  pool sequencing  candidate genes
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