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棉花黄萎病菌ISSR反应体系优化及其遗传多样性分析
引用本文:刘燕霞,侯丽娟,李卫,杨家荣,肖蕊.棉花黄萎病菌ISSR反应体系优化及其遗传多样性分析[J].植物保护学报,2010,37(5):425-430.
作者姓名:刘燕霞  侯丽娟  李卫  杨家荣  肖蕊
作者单位:西北农林科技大学植物保护学院, 陕西省农业分子生物学重点实验室, 杨凌 712100;西北农林科技大学植物保护学院, 陕西省农业分子生物学重点实验室, 杨凌 712100;西北农林科技大学植物保护学院, 陕西省农业分子生物学重点实验室, 杨凌 712100;西北农林科技大学植物保护学院, 陕西省农业分子生物学重点实验室, 杨凌 712100;西北农林科技大学植物保护学院, 陕西省农业分子生物学重点实验室, 杨凌 712100
基金项目:国家公益性行业(农业)科研专项(3-19);高等学校学科创新引智计划项目(B07049)
摘    要:为给棉花黄萎病菌分子变异及遗传多样性研究提供可靠的检测方法,以棉花黄萎病菌基因组DNA为模板,采用正交优化方法对PCR体系中DNA聚合酶、引物、dNTPs、DNA模板、Mg2+及10×Buffer等重要参数进行6因素4水平优化,建立了棉花黄萎病菌ISSR-PCR优化反应体系,并从20条ISSR通用引物中筛选出多态性较好的10条引物。采用该优化反应体系和10条ISSR引物对采自陕西棉花主产区的21个棉花黄萎病菌菌株和3个参照菌株进行ISSR分析。结果显示,10条ISSR引物共扩增出87条谱带,条带分子量均在250~2 000 bp之间,平均每条引物扩增出8.7个条带,其中58条为多态性条带,占65.2%。聚类分析结果显示,在相似系数0.59处,供试菌株分为2个遗传类型。表明棉花黄萎病菌菌株间的亲缘关系与地理来源存在一定的相关性,而与其病害症状类型无相关性。

关 键 词:棉花黄萎病菌  ISSR  正交试验  遗传多样性
收稿时间:2010/1/18 0:00:00

Optimization of ISSR reaction and analysis of genetic diversity of Verticillium dahliae in cotton
Liu Yanxi,Hou Lijuan,Li Wei,Yang Jiarong and Xiao Rui.Optimization of ISSR reaction and analysis of genetic diversity of Verticillium dahliae in cotton[J].Acta Phytophylacica Sinica,2010,37(5):425-430.
Authors:Liu Yanxi  Hou Lijuan  Li Wei  Yang Jiarong and Xiao Rui
Institution:Shaanxi Key Laboratory of Molecular Biology for Agricultrue, College of Plant Protection, Northwest A & F University, Yangling 712100, Shaanxi Province, China;Shaanxi Key Laboratory of Molecular Biology for Agricultrue, College of Plant Protection, Northwest A & F University, Yangling 712100, Shaanxi Province, China;Shaanxi Key Laboratory of Molecular Biology for Agricultrue, College of Plant Protection, Northwest A & F University, Yangling 712100, Shaanxi Province, China;Shaanxi Key Laboratory of Molecular Biology for Agricultrue, College of Plant Protection, Northwest A & F University, Yangling 712100, Shaanxi Province, China;Shaanxi Key Laboratory of Molecular Biology for Agricultrue, College of Plant Protection, Northwest A & F University, Yangling 712100, Shaanxi Province, China
Abstract:
Keywords:Verticillium dahliae  ISSR  orthogonal design  genetic diversity
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