| 假禾谷镰孢中三角状五肽重复蛋白的全基因组鉴定与表达分析 |
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| 引用本文： | 王利民,孟家兴,庄训宇,张媛,李海洋,陈琳琳,汪敏,丁胜利,李洪连.假禾谷镰孢中三角状五肽重复蛋白的全基因组鉴定与表达分析[J].植物病理学报,2022,52(3):341-351. |
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| 作者姓名： | 王利民 孟家兴 庄训宇 张媛 李海洋 陈琳琳 汪敏 丁胜利 李洪连 |
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| 作者单位： | 河南农业大学植物保护学院/小麦玉米作物学国家重点实验室/河南粮食作物协同创新中心,郑州 450002 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（31871922）;国家自然科学基金国际（地区）合作与交流项目（31961143018）； |
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| 摘 要： | 假禾谷镰孢(Fusarium pseudograminearum, Fp)是引起小麦茎基腐病的优势病原菌,但关于该病原菌致病机理的研究报道很少。三角状五肽重复蛋白(Pentatricopeptide repeat protein,Ppr)为一类核编码的RNA结合蛋白,通过结合特定的RNA序列调控靶标基因RNA的成熟过程,参与线粒体基因组转录和翻译。Ppr蛋白在植物、动物(包括人)及酵母中有一些研究报道,但在丝状真菌特别是植物病原真菌中鲜见报道。为了明确假禾谷镰孢中PPR基因家族的特征,本研究通过全基因组Blastp分析,共鉴定出8个PPR候选基因序列FpPPR1~FpPPR8,主要分布在1号、3号、4号染色体上,基本不含有内含子。理化性质与功能预测显示,Ppr为亲水性蛋白,氨基酸长度510~1 353 aa,分子量59.09~152.23 kDa,等电点为5.23~9.69,其中FpPpr3和FpPpr7为稳定蛋白,其他6个蛋白为不稳定蛋白。亚细胞定位预测显示,Ppr蛋白主要位于线粒体。FpPpr1、FpPpr3、FpPpr5、FpPpr6和FpPpr7的3D结构预测形成明显的超螺旋结构。在假禾谷镰孢营养阶段和侵染过程的转录组数据中分析了8个基因表达模式,通过qRT-PCR进行验证,FpPPR1、FpPPR3、FpPPR5在菌丝阶段高表达,FpPPR1、FpPPR5在侵染后期显著下调。本研究结果为进一步研究假禾谷镰孢中PPRs基因的生物学功能奠定基础。
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| 关 键 词： | 小麦茎基腐病 假禾谷镰孢 三角状五肽重复蛋白(Ppr) Blastp分析 表达模式 |
| 收稿时间： | 2021-04-28 |
Genome-wide identification and expression analysis of pentatricopeptide repeat proteins in Fusarium pseudograminearum |
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| WANG Limin,MENG Jiaxing,ZHUANG Xunyu,ZHANG Yuan,LI Haiyang,CHEN Linlin,WANG Min,DING Shengli,LI Honglian.Genome-wide identification and expression analysis of pentatricopeptide repeat proteins in Fusarium pseudograminearum[J].Acta Phytopathologica Sinica,2022,52(3):341-351. |
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| Authors: | WANG Limin MENG Jiaxing ZHUANG Xunyu ZHANG Yuan LI Haiyang CHEN Linlin WANG Min DING Shengli LI Honglian |
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| Institution: | College of Plant Protection, Henan Agricultural University/State Key Laboratory of Wheat and Corn Crop Science/Henan Food Crops Collaborative Innovation Center, Zhengzhou 450002, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Fusarium crown rot Fusarium pseudograminearum pentatricopeptide repeat protein (Ppr) Blastp analysis expression pattern |
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