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鲤与生长性状相关的EST-SSRs标记筛选
引用本文:顾颖,曹顶臣,张研,常玉梅,李鸥,张晓峰,鲁翠云,孙效文.鲤与生长性状相关的EST-SSRs标记筛选[J].中国水产科学,2009,16(1).
作者姓名:顾颖  曹顶臣  张研  常玉梅  李鸥  张晓峰  鲁翠云  孙效文
作者单位:1. 中国水产科学研究院,黑龙江水产研究所;农业部北方鱼类生物工程育种重点开放实验室,黑龙江,哈尔滨150070;大连水产学院,生命科学与技术学院,辽宁,大连,116023
2. 中国水产科学研究院,黑龙江水产研究所;农业部北方鱼类生物工程育种重点开放实验室,黑龙江,哈尔滨150070
3. 中国水产科学研究院,黑龙江水产研究所;农业部北方鱼类生物工程育种重点开放实验室,黑龙江,哈尔滨150070;上海海洋大学,生命科学与技术学院,上海,200090
4. 中国水产科学研究院,黑龙江水产研究所;农业部北方鱼类生物工程育种重点开放实验室,黑龙江,哈尔滨150070;中山大学,生命科学学院,广东,广州,510275
基金项目:国家重点基础研究发展计划(973计划) 
摘    要:以大头鲤(Cyprinus pellegrini Tchang)(母本)与荷包红鲤(Cyprinus carpio wuyuanensis)抗寒品系(父本)杂交产生的F1作为亲本,以其自交F2作为分离群体,结合"拟测交"策略,用EST-SSRs标记对其中92个个体进行基因型检测.利用Windows Map Manager 2.0的标记回归法对符合拟测交分离的70个EST-SSRs标记进行单标记回归分析,检测出8个与鲤体长、体高、体厚性状相关的标记.对同一标记不同基因型个体间生长性状进行显著性比较,通过t检验,找到与生长性状相关的基因型.将上述8个EST序列与GenBank数据库进行BLAST比对,有3条EST序列与蛋白库中已知功能的序列高度同源.其中HLJE225与编码斑马鱼(J9enio rerio)冷诱导基因RNA结合蛋白的基因同源性水平高达97%,HLJE222与编码斑马鱼DAZ相关蛋白1基因同源性水平也高达97%,HLJE599与编码斑点叉尾鲴(Ictalurus punctatus)核糖体蛋白L6基因的同源水平为87%.本研究鉴定的与鲤生长性状相关的功能基因及有利用价值的基因型,为鲤重要生长性状的QTL(数量性状基闪座)定位和分子标记辅助育种提供了一定的依据.中国水产科学,2009,16(1):15-22]

关 键 词:  生长性状  冷诱导基因RNA结合蛋白  DAZ相关蛋白1  核糖体蛋白L6

Screening of EST-SSRs markers related to growth traits in common carp(Cyprinus carpio L.)
GU Ying,CAO Ding-chen,ZHANG Yan,CHANG Yu-mei,LI Ou,ZHANG Xiao-feng,LU Cui-yun,SUN Xiao-wen.Screening of EST-SSRs markers related to growth traits in common carp(Cyprinus carpio L.)[J].Journal of Fishery Sciences of China,2009,16(1).
Authors:GU Ying  CAO Ding-chen  ZHANG Yan  CHANG Yu-mei  LI Ou  ZHANG Xiao-feng  LU Cui-yun  SUN Xiao-wen
Abstract:
Keywords:EST-SSRs  BLAST
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