| 鲉形目鱼类DNA条形码分析及鲉科DNA条形码电子芯片建立 |
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| 引用本文： | 柳淑芳,李献儒,杨钰,杨善军,庄志猛.鲉形目鱼类DNA条形码分析及鲉科DNA条形码电子芯片建立[J].中国水产科学,2016(5):1006-1022. |
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| 作者姓名： | 柳淑芳 李献儒 杨钰 杨善军 庄志猛 |
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| 作者单位： | 1. 中国水产科学研究院黄海水产研究所,山东青岛266071;青岛海洋科学与技术国家实验室,海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室,山东青岛266200;2. 中国水产科学研究院黄海水产研究所,山东青岛266071;大连海洋大学水产与生命学院,辽宁大连116023;3. 国家海洋局第三海洋研究所,福建厦门,361005;4. 中国水产科学研究院黄海水产研究所,山东青岛266071;青岛海洋科学与技术国家实验室,海洋生物学与生物技术功能实验室,山东青岛266200 |
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| 基金项目： | 海洋公益性行业科研专项经费项目(201205024)，山东省科技发展计划项目(2012GHY11531)，厦门市科技计划项目(3502Z20132005) |
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| 摘 要： | 为建立鲉形目内各物种的快速鉴别方法,本研究扩增了我国47个鲉形目物种并下载了Gen Bank上收录的鲉形目共计23科85属233种873条细胞色素C氧化酶I基因(COI)序列,分析该基因结构特性。结果表明,鲉形目DNA条形码基因的碱基变异中,不变位点508个,占总位点数的82.1%;转换位点70个,颠换位点41个,分别占总位点数的11.3%和6.6%;种内遗传距离为0~0.019,平均遗传距离为0.003?0.0034;属内种间遗传距离为0.003~0.258,平均值为0.086?0.038;基于233个物种的COI序列构建的系统进化树显示,227个物种(97.4%)能聚为独立分支,且具有较高支持度。在此基础上以鲉科11属39种鱼类的DNA条形码为例,筛选出25个种的37个特异性探针,以此探针对鲉科鱼类进行物种快速鉴定成功率为64.1%,研究结果表明DNA条形码芯片用于鲉科的鉴定具有一定的可行性。
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| 关 键 词： | 鲉形目 鲉科 DNA条形码 DNA条形码芯片 |
A DNA barcode for the Scorpaeniformes and construction of a DNA microarray for Scorpaenidae fish |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Scorpaeniformes Scorpaenidae DNA barcode DNA microarray |
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