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魁蚶核糖体DNA基因转录间隔区的序列特征
引用本文:陈琳琳,孔晓瑜,周立石,陈丽梅,喻子牛.魁蚶核糖体DNA基因转录间隔区的序列特征[J].中国水产科学,2005,12(1):104-108.
作者姓名:陈琳琳  孔晓瑜  周立石  陈丽梅  喻子牛
作者单位:中国海洋大学,海水养殖教育部重点实验室,山东,青岛,266003
基金项目:国家"973"基础研究项目资助(G1999012008),中国科学院海洋研究所实验海洋生物学开放研究实验室项目资助(No 307).
摘    要:以相应引物PCR扩增魁蚶(Scapharca broughtonii)的核糖体转录间隔子ITS-1和ITS-2片段,测序后得到长度分别为461bp和533bp的核苷酸序列(含引物)。其中A、T、G、C4种碱基的含量分别为21.91%、24.73%、28.20%和25.16%(ITS-1),27.02%、25.52%、25.52%和21.95%(ITS-2)。将这2个片段与其他双壳贝类的相应片段进行比较,发现11S1和11S2引物在贝类中具有良好的通用性。比较几种贝类的11S1片段发现有1~100bp长度不等、弥散状态的插入/缺失;对5种蚶科贝类的ITS-2相应片段进行比较,发现中间有75bp的保守区域,与本研究在魁蚶ITS-2群体序列研究中观察到的情况相同。

关 键 词:魁蚶  核苷酸序列  ITS-1  ITS-2
文章编号:1005-8737-(2005)01-0104-05
修稿时间:2004年4月19日

Sequence analysis of ribosomal DNA internal transcribed spacers of bloody clam,Scapharca broughtonii
CHEN Lin-lin,KONG Xiao-yu,ZHOU Li-shi,CHEN Li-mei,YU Zi-niu of China,Qingdao ,China.Sequence analysis of ribosomal DNA internal transcribed spacers of bloody clam,Scapharca broughtonii[J].Journal of Fishery Sciences of China,2005,12(1):104-108.
Authors:CHEN Lin-lin  KONG Xiao-yu  ZHOU Li-shi  CHEN Li-mei  YU Zi-niu of China  Qingdao  China
Institution:CHEN Lin-lin,KONG Xiao-yu,ZHOU Li-shi,CHEN Li-mei,YU Zi-niu of China,Qingdao 266003,China)
Abstract:
Keywords:Scapharca broughtonii  nucleotide sequence  ITS-1  ITS-2
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