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三疣梭子蟹基因组微卫星特征分析
引用本文:宋来鹏,刘萍,李健,刘振辉.三疣梭子蟹基因组微卫星特征分析[J].中国水产科学,2008,15(5).
作者姓名:宋来鹏  刘萍  李健  刘振辉
作者单位:1. 中国水产科学研究院,黄海水产研究所,山东,青岛,266071;中国海洋大学,海洋生命学院,山东,青岛,266003
2. 中国水产科学研究院,黄海水产研究所,山东,青岛,266071
3. 中国海洋大学,海洋生命学院,山东,青岛,266003
基金项目:国家高技术研究发展计划(863计划),国家高技术研究发展计划(863计划),国家高技术研究发展计划(863计划)
摘    要:对三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)部分基因组DNA文库测序,获得了总长度为622409个碱基的基因组DNA序列,从中找到微卫星重复序列(1~6bp重复)697个.统计微卫星重复类型,以两碱基重复数目最多,为445个,占微卫星序列总数目的63.84%;其次是三碱基重复152个,占21.81%;再次分别是单碱基重复45个,占6.46%;四碱基重复31个,占4.45%;五碱基重复14个,占2.01%;六碱基重复1个,占1.43%.在单碱基重复类型中,重复拷贝类别全部为A:两碱基重复类型中,AG重复数目最多,其次是AC和AT;三碱基重复类型中以ACT最多,其次是AGG和AAT;四碱基重复类型中,AGAC重复数目最多;五碱基重复类型中,以AACCT重复拷贝类别最多;六碱基重复中以AGGGGA重复数目最多.GC重复拷贝类别的重复数目很少,只发现1个(GenBank注册号为EU113241).

关 键 词:三疣梭子蟹  基因组  微卫星
修稿时间:2010/4/8 0:00:00

Analysis of microsatellite sequences in genome of crab,Portunus trituberculatus
SONG Lai-peng,LIU Ping,LI Jian,LIU Zhen-hui.Analysis of microsatellite sequences in genome of crab,Portunus trituberculatus[J].Journal of Fishery Sciences of China,2008,15(5).
Authors:SONG Lai-peng  LIU Ping  LI Jian  LIU Zhen-hui
Abstract:
Keywords:
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