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| 草鱼三、四核苷酸重复微卫星标记的分离与特征分析 | |
| 引用本文： | 李文升,刘翠,鲁翠云,李超,孙效文.草鱼三、四核苷酸重复微卫星标记的分离与特征分析[J].中国水产科学,2011,18(4):742-750. |
| 作者姓名： | 李文升 刘翠 鲁翠云 李超 孙效文 |
| 作者单位： | 1. 上海海洋大学水产与生命学院,上海 201306;中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,农业部北方鱼类生物工程育种重点开放实验室,黑龙江哈尔滨 150070 2. 中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,农业部北方鱼类生物工程育种重点开放实验室,黑龙江哈尔滨 150070;哈尔滨师范大学,黑龙哈尔滨 150025 3. 中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,农业部北方鱼类生物工程育种重点开放实验室,黑龙江哈尔滨 150070 |
| 基金项目： | 国家973计划资助项目 |
| 摘 要： | 采用磁珠富集法、通过质粒检测法结合同位素杂交检测获得草鱼(Ctenopharyngodon idellu)三、四核苷酸阳性克隆1 378个,测序705个,共得到846个微卫星座位,其中完美型632个（占74.7％）,非完美型114个(占13.48％),混合型100个(占11.82％).根据微卫星侧翼序列设计并合成100对微卫星引物,检测结果显示35对(35％)引物在邘江野生群体中表现出多态性.选择其中2对多态性稳定的引物进行遗传多样分析,结果显示,20个位点共检测到212个等位基因,平均观察杂合度(Ho)为0.681 1,平均期望杂合度（He）为0.797 5,平均多态信息含量为0.777 7.结果表明,所筛选的微卫星标记能够用于草鱼群体遗传学研究.本研究旨在为草鱼的种群遗传结构分析、遗传图谱构建等研究奠定基础. |
| 关 键 词： | 草鱼 微卫星标记 微卫星文库 多态性 |
| 修稿时间： | 2011/8/16 0:00:00 |
Isolation and characterization of tri- and tetranucleotide repeat microsatellites in grass carp (Ctenopharyngodon idellus) |
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| LI Wensheng,LIU Cui,LU Cuiyun,LI Chao,SUN Xiaowen.Isolation and characterization of tri- and tetranucleotide repeat microsatellites in grass carp (Ctenopharyngodon idellus)[J].Journal of Fishery Sciences of China,2011,18(4):742-750. | |
| Authors: | LI Wensheng LIU Cui LU Cuiyun LI Chao SUN Xiaowen |
| Institution: | LI Wensheng1,2,LIU Cui2,3,LU Cuiyun2,LI Chao2,SUN Xiaowen2 1.College of Fisheries and Life Science,Shanghai Ocean University,Shanghai 201306,China 2.Heilongjiang River Fisheries Research Institute,Chinese Academy of Fishery Sciences,Harbin 150070,China 3.College of Life Science and Technology,Harbin Normal University,Heilongjiang Harbin 150025,China |
| Abstract: | We isolated microsatellites of grass carp(Ctenopharyngodon idellus) by an enrichment by magnetic beads technique.One thousand three hundred and seventy-eight positive clones were obtained at the second screening by hybridization with ATP-labeled probes.Eight hundred and forty-six microsatellites were ulti-mately isolated from 705 positive clones.There were 632(74.7%) perfect motifs,114(13.48%) imperfect motifs,and 100(11.82%) compound motifs among the sequences.One hundred and thirty-seven primer pairs were... |
| Keywords: | Ctenopharyngodon idellu microsatellite polymorphism |
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