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栉孔扇贝在镉污染胁迫下消化盲囊组织的转录组分析
引用本文:张辉,翟毓秀,姚琳,江艳华,李风铃.栉孔扇贝在镉污染胁迫下消化盲囊组织的转录组分析[J].中国水产科学,2017,24(4):802-810.
作者姓名:张辉  翟毓秀  姚琳  江艳华  李风铃
作者单位:农业部水产品质量安全检测与评价重点实验室, 中国水产科学研究院 黄海水产研究所, 山东 青岛 266071;农业部水产品质量安全风险评估实验室(青岛), 山东 青岛 266071
基金项目:国家自然科学基金项目(41506134)
摘    要:镉(Cd)作为生物非必需、毒性极强的蓄积性重金属,易通过食物链进入人体,严重威胁人类健康。扇贝相对于其他贝类具有特异性蓄积镉的能力,成为水产品安全领域关注的焦点。为了阐释扇贝高蓄积镉的分子机制,本研究以镉胁迫的栉孔扇贝(Chlamys farreri)消化盲囊组织为研究对象,通过转录组测序技术进行基因转录水平分析。通过比较转录组拼接获得105071个unigene和3800个差异基因,对所得unigene进行功能注释,发现这些基因集中在蛋白绑定、细胞黏附、免疫应答、细胞凋亡和能量代谢等方面。对这些蛋白的分子功能进行注释,发现该类蛋白主要属结合蛋白(40.45%)、催化活性蛋白(34.27%)和转运蛋白(5.62%)。这些功能基因和预测通路为理解扇贝体内解毒和免疫系统奠定了基础。获得的转录组数据为深入研究双壳贝类应对海洋污染物的分子机制提供了丰富的基因资源。

关 键 词:栉孔扇贝    比较转录组  差异表达基因
修稿时间:2017/7/21 0:00:00

Discovery of genes associated with cadmium accumulation from the digestive gland of scallop Chlamys farreri by using high-throughput sequencing
ZHANG Hui,ZHAI Yuxiu,YAO Lin,JIANG Yanhu,LI Fengling.Discovery of genes associated with cadmium accumulation from the digestive gland of scallop Chlamys farreri by using high-throughput sequencing[J].Journal of Fishery Sciences of China,2017,24(4):802-810.
Authors:ZHANG Hui  ZHAI Yuxiu  YAO Lin  JIANG Yanhu  LI Fengling
Institution:1. Key Laboratory of Testing and Evaluation for Aquatic Product Safety and Quality, Ministry of Agriculture, China;Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Qingdao 266071, China;2. Laboratory of Quality and Safety Risk Assessment for Aquatic Products(Qingdao), Ministry of Agriculture, Qingdao 266071, China
Abstract:
Keywords:
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