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三角帆蚌微卫星富集文库的构建、鉴定及多态性分析
引用本文:许巧情,谢骏,张书环,赵朝阳,袁汉文.三角帆蚌微卫星富集文库的构建、鉴定及多态性分析[J].中国水产科学,2010,17(6).
作者姓名:许巧情  谢骏  张书环  赵朝阳  袁汉文
作者单位:1. 中国水产科学研究院,淡水渔业研究中心,农业部淡水鱼类遗传育种和养殖生物学重点开放实验室,江苏,无锡,214081;长江大学,动物科学学院,湖北,荆州,434025
2. 中国水产科学研究院,淡水渔业研究中心,农业部淡水鱼类遗传育种和养殖生物学重点开放实验室,江苏,无锡,214081
3. 中国科学院水生生物研究所,湖北,武汉,430072
4. 长江大学,动物科学学院,湖北,荆州,434025
基金项目:农业部淡水鱼类遗传育种和养殖生物学重点开放实验室开放基金资助项目,湖北省教育厅科研基金资助项目 
摘    要:通过磁珠富集法构建了三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)微卫星富集文库。共获得800个阳性克隆,其中的100个阳性克隆经测序分析,共获得微卫星序列54个。利用这些微卫星序列可设计33对引物,经过PCR扩增筛选获得了25对可用引物。利用聚丙烯酰胺凝胶电泳,对洞庭湖1个种群的30只三角帆蚌进行扩增,发现13对引物呈现多态性,等位基因数在4~9。观测杂合度在0.2543~0.9827,期望杂合度在0.3629~0.8217,信息多态含量平均为0.5198。由于存在无效等位基因,两个微卫星基因座(GenBank登录号为GQ302651和GQ302658)明显地偏离哈代-温伯格平衡,但没有发现连锁不平衡现象。这说明利用磁珠富集法构建的三角帆蚌微卫星文库质量较好,13对多态性微卫星引物可为三角帆蚌微卫星连锁图谱构建、分子进化和系统发育研究、分子标记辅助育种以及经济性状的QTL定位提供帮助。

关 键 词:三角帆蚌  微卫星富集文库  PCR扩增  多态性
修稿时间:2010/11/19 0:00:00

Isolation, characterization and polymorphism of microsatell markers in triangle mussel Hyriopsis cumingii
XU Qiaoqing,XIE Jun,ZHANG Shuhuan,ZHAO Chaoyang,YUAN Hanwen.Isolation, characterization and polymorphism of microsatell markers in triangle mussel Hyriopsis cumingii[J].Journal of Fishery Sciences of China,2010,17(6).
Authors:XU Qiaoqing  XIE Jun  ZHANG Shuhuan  ZHAO Chaoyang  YUAN Hanwen
Abstract:
Keywords:
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