| 鳜pep和gh基因SNP标记与驯食性状的关联分析 |
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| 引用本文： | 窦亚琪,梁旭方,高俊杰,何珊,石林杰,史登勇.鳜pep和gh基因SNP标记与驯食性状的关联分析[J].中国水产科学,2020,27(5):485-493. |
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| 作者姓名： | 窦亚琪 梁旭方 高俊杰 何珊 石林杰 史登勇 |
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| 作者单位： | 1. 华中农业大学水产学院, 华中农业大学鳜鱼研究中心;农业农村部鳜鱼育种创新基地, 农业农村部淡水生物繁育重点实验室, 湖北 武汉 430070;2. 湖北省水产技术推广总站(湖北省水产良种引进繁育中心), 湖北 武汉 430070;3. 湖北省水产良种试验站, 湖北 武汉 430070 |
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| 基金项目： | 农业农村部现代农业产业技术体系专项资金资助项目（CARS-46）；国家重点研发计划“蓝色粮仓科技创新”项目（2018YFD0900400）；武汉市青年科技晨光计划项目（2017050304010318）. |
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| 摘 要： | 以鳜(Siniperca chuatsi)选育群体为实验材料,在易驯食与不易驯食鳜转录组Unigene数据库中共预测到4809个SNP位点,其中胃蛋白酶基因(pepsinoge, pep)和生长激素基因(growth hormone, gh)均为转录组筛选获得的鳜驯食性状候选基因,本研究将候选基因上的多态SNP位点在易驯食和不易驯食鳜群体中进行基因分型,并与鳜驯食性状进行关联分析。在易驯食与不易驯食的鳜群体中共发现5个单核苷酸(SNP)多态性位点,有效等位基因(N_e)在1.1959～1.7001,观测杂合度(H_o)和期望杂合度(H_e)分别分布于0.1800～0.3585和0.1655～0.4160,多态信息含量(PIC)为0.2477,全部位点都属于中度多态性位点。结果表明SNP位点pep-A T/C中2种基因型TT和CT与鳜驯食性状呈高水平显著相关(P0.05),组合得到的3种基因型Genotype1(CT,CC/CT/TT,AA,AA,TT)、Genotype2(TT,CC/CT/TT, AA, AA, TT)和Genotype3(TT, CC, AA, AA, TT)也与鳜驯食性状呈高水平显著相关(P0.05),显著影响鳜驯食性状表型,其中Genotype2相关性最高,可作为最优基因型个体进行选育。本研究在鳜pep和gh基因中鉴定出与驯食性状呈显著关联的SNP分子标记,为加快易驯食鳜新品种的基因辅助选育提供有效的SNP分子标记。
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| 关 键 词： | 翘嘴鳜 驯食性状 单核苷酸多态性(SNP) 关联分析 |
Single nucleotide polymorphisms in pepsinogen gene, growth hormone gene and their association with food habit domestication traits in Siniperca chuatsi |
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| DOU Yaqi,LIANG Xufang,GAO Junjie,HE Shan,SHI Linjie,SHI Dengyong.Single nucleotide polymorphisms in pepsinogen gene, growth hormone gene and their association with food habit domestication traits in Siniperca chuatsi[J].Journal of Fishery Sciences of China,2020,27(5):485-493. |
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| Authors: | DOU Yaqi LIANG Xufang GAO Junjie HE Shan SHI Linjie SHI Dengyong |
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| Institution: | 1. College of Fisheries, Chinese Perch Research Center, Huazhong Agricultural University;Innovation Base for Chinese Perch Breeding, Key Lab of Freshwater Animal Breeding, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Wuhan 430070, China;2. Hubei Aquaculture Technology Extension Center(Hubei Aquatic Breeds Introduction and Breeding Center), Wuhan 430070, China;3. Hubei Province Aquatic Stains Testing Station, Wuhan 430070, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | , food habit domestication traits, single nucleotide polymorphism (SNP), correlation analysis |
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