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| 缢蛏ScHsc70 cDNA的分子特性和表达分析 | |
| 引用本文： | 冯冰冰,牛东红,钟玉民,陈慧,林国文,李家乐.缢蛏ScHsc70 cDNA的分子特性和表达分析[J].中国水产科学,2012,19(1):33-44. |
| 作者姓名： | 冯冰冰 牛东红 钟玉民 陈慧 林国文 李家乐 |
| 作者单位： | 1. 上海海洋大学水产与生命学院,农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室,上海201306 2. 福建省闽东水产研究所,福建宁德,352100 3. 上海海洋大学水产与生命学院,农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室,上海201306;上海市高校水产养殖学E研究院,上海海洋大学水产与生命学院,上海201306 |
| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划项目，福建省海洋与渔业局重点项目，上海高校创新团队建设项目，上海高校选拔培养优秀青年教师科研专项基金 |
| 摘 要： | 从缢蛏(Sinonovacula constricta Lamarck)cDNA文库中筛选出一条热休克蛋白70(Heat shock protein 70,HSP70)同源序列,采用EST扩增和5′RACE(rapid amplification of cDNA ends,RACE)扩增方法获得全长cDNA序列,共2 335 bp,包括76 bp的5′非翻译区和309 bp的3′非翻译区,以及1 950 bp的开放阅读框。阅读框共编码649个氨基酸,推算的分子量约为70.89 kD,理论等电点为5.28。氨基酸序列分析结果表明,该基因的氨基酸序列含有HSP70家族的3个签名序列,2个糖基化位点,1个ATP-GTP结合位点,且C末端具有GGXP四肽重复序列以及细胞质特异性调控基序EEVD。该基因是组成型HSC70(Heat shock cognate 70)亚家族基因成员,被命名为ScHsc70。基于氨基酸序列的双壳贝类聚类分析表明,缢蛏与南极帽贝(Laternula elliptica)、文蛤(Meretrix meretrix)的亲缘关系最近。荧光定量表达分析显示,ScHsc70 mRNA在缢蛏水管、鳃、斧足、外套膜、肝和性腺等组织中以不同水平存在,其中在外套膜中的表达量最低,而在水管和肝中的表达量最高。经副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)和副鳗弧菌(V.anguillarum)诱导后,ScHsc70 mRNA在缢蛏肝中的水平呈现先升高后下降的变化趋势,且分别在感染后的第20小时和第30小时达到最高。结果提示,缢蛏ScHsc70基因可能参与了对细菌感染的防御反应。 |
| 关 键 词： | 缢蛏 热休克蛋白70 序列分析 基因表达 |
| 修稿时间： | 2012/2/1 0:00:00 |
Molecular characteristics and expression analysis of ScHsc70 cDNA in agamaki clam (Sinonovacula constricta) |
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| FENG Bingbing,NIU Donghong,ZHONG Yumin,CHEN Hui,LIN Guowen,LI Jiale.Molecular characteristics and expression analysis of ScHsc70 cDNA in agamaki clam (Sinonovacula constricta)[J].Journal of Fishery Sciences of China,2012,19(1):33-44. | |
| Authors: | FENG Bingbing NIU Donghong ZHONG Yumin CHEN Hui LIN Guowen LI Jiale |
| Institution: | 1,3 1.Key Laboratory of Exploration and Utilization of Aquatic Genetic Resources,Shanghai Ocean University, Ministry of Education,Shanghai 201306,China; 2.Mindong Fisheries Research Institute,Ningde 352100,China; 3.Aquaculture Division,E-Institute of Shanghai Universities;College of Fisheries and Life Science,Shanghai Ocean University,Shanghai 201306,China |
| Abstract: | |
| Keywords: | Sinonovacula constricta heat shock protein 70 sequence analysis gene expression |
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