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| 圆斑星鲽线粒体基因组全序列结构及其进化 | |
| 引用本文： | 赫崇波,高祥刚,王效敏,刘卫东,周遵春,木云雷,葛陇利.圆斑星鲽线粒体基因组全序列结构及其进化[J].中国水产科学,2007,14(4):584-592. |
| 作者姓名： | 赫崇波 高祥刚 王效敏 刘卫东 周遵春 木云雷 葛陇利 |
| 作者单位： | 1. 辽宁省海洋水产科学研究院,辽宁省海洋水产分子生物学重点实验室,辽宁省应用海洋生物技术开放实验室,辽宁,大连116023 2. 辽宁师范大学,实验分析中心,辽宁,大连,116029 3. 大连水产学院,生命科学与技术学院,辽宁,大连,116023 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金;国家海洋科技推进平台与运行项目 |
| 摘 要： | 利用圆斑星鲽(Verasper variegatus Temminck et Schlegel)和相关鱼类的部分线粒体基因序列,设计出6对扩增引物,通过PCR扩增产物直接测序和引物行走(Primer walking)法测定圆斑星鲽线粒体基因组全序列,并对其进行结构与进化分析。圆斑星鲽线粒体基因组序列长17273 bp,其基因序列及构成都与其他硬骨鱼基本相同,包括37个基因(2个rRNA基因、22个tRNA基因和13个蛋白质编码基因)和2个非编码区(控制区和WANCY区)。在22个tRNA基因中,tRNAGln、tRNAAla、tRNAAsn、tRNACys、tRNATyr、tRNASer(第2个)、tRNAGlu和tRNAPro的编码基因位于L链上,其余则位于H链上。在13个蛋白质编码基因中,除了COⅠ基因的起始密码子为GTG外,其余均以ATG为起始密码子。蛋白质编码基因包括具有完整TAA终止密码子的ND1,COⅠ,ATP8,ND4L,ND5,而其他蛋白编码基因则具有不完全终止密码子。在L链上,ND6是仅有的一个蛋白质编码基因。圆斑星蝶的控制区包含1个终止相关序列区(ETAS)、6个中央保守序列区(CSB-A、B、C、D、E、F)和3个保守序列区(CSB-1、2、3)以及长串联重复区(Tandemly repeat sequence)。用NJ法和MP法对5个目22种鱼mtDNA的13个蛋白质编码基因的氨基酸序列进行系统分析,结果显示,圆斑星蝶与石鲽关系最近,鲽形目的鲆、鲽类与鲈形目的科(Carangidae)、鲷科(Sparidae)鱼类亲缘关系较近,而同属于鲽形目的塞内加尔鳎(Solea senegalensis)没有和任何目聚在一起,成为一个独立的分支。圆斑星蝶的基因组全序列序列已提交到GenBank,登录号为DQ403797,控制区单元型序列的GenBank登录号为DQ834444~7。 |
| 关 键 词： | 圆斑星鲽 线粒体基因组 控制区 系统进化 |
| 文章编号： | 1005-8737-（2007）04-0584-09 |
| 收稿时间： | 2006-09-24 |
| 修稿时间： | 2006-09-242007-03-05 |
Structure and evolution of complete mitochondrial genome of spotted halibut Verasper variegatus |
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| HE Chong-bo,GAO Xiang-gang,WANG Xiao-min,LIU Wei-dong,ZHOU Zun-chun,MU Yun-lei,GE Long-li.Structure and evolution of complete mitochondrial genome of spotted halibut Verasper variegatus[J].Journal of Fishery Sciences of China,2007,14(4):584-592. | |
| Authors: | HE Chong-bo GAO Xiang-gang WANG Xiao-min LIU Wei-dong ZHOU Zun-chun MU Yun-lei GE Long-li |
| Abstract: | |
| Keywords: | Verasper variegatus mitochondrial genome control region phylogeny |
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