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鲹科鱼类DNA条形码分类系统
引用本文:杨龙,李昂,李步苏,王焕,柳淑芳,庄志猛.鲹科鱼类DNA条形码分类系统[J].中国水产科学,2021,28(12):1523-1535.
作者姓名:杨龙  李昂  李步苏  王焕  柳淑芳  庄志猛
作者单位:浙江海洋大学水产学院, 浙江 舟山 316022 ;中国水产科学研究院黄海水产研究所, 农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室, 山东 青岛 266071 ;青岛海洋科学与技术试点国家实验室, 海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室, 山东 青岛 266071
基金项目:国家自然科学基金项目(42076132); 中国水产科学研究院基本科研业务费资助项目(2021JC01); 国家海洋水产种质资源库项目.
摘    要:为了验证 DNA 条形码在鲹科(Carangidae)鱼类物种鉴定和系统分类中的适用性, 本研究自测 6 属 7 种 17 条序列, 同时筛选了 BOLD 数据库中的有效序列, 共获得 25 属 95 种 273 条鲹科鱼类 DNA 条形码序列, 通过 BLAST 比对、遗传距离和系统关系树, 构建了鲹科鱼类的 DNA 条形码分类系统。结果表明: (1)鲹科鱼类属间、种间、属内种间和种内三级分类单元遗传距离的平均水平分别为 0.186、0.169、0.090 和 0.008, 种间平均遗传距离是种内平均遗传距离的 21 倍, 可见 DNA 条形码适用于鲹科鱼类分类鉴定; (2)运用 DNA 条形码技术可以识别出形态鉴定有误的物种, 表明 DNA 条形码可以弥补传统形态学鉴定的局限性, 可对鲹科鱼类形态学分类结果进行精准修正; (3)鲹科鱼类 DNA 条形码分析表明, BOLD 数据库中仍存在一定的“同种异名”和“异种同名”现象, 建议使用该数据库信息时应严格评估信息的准确性; (4)鲹科鱼类系统发生关系研究对物种的分类地位提出了新的见解, 即拟鲳鲹 (Parona signata)和镰鳍波线鲹(Lichia amia)亲缘关系较近, 支持将二者均归为鲳鲹亚科(Trachinotinae)。本研究旨在为丰富鲹科鱼类 DNA 条形码数据, 完善鲹科 DNA 条形码分类系统, 并为鲹科鱼类物种鉴定和系统分类提供分子证据。

关 键 词:鲹科    DNA  条形码    分类鉴定    系统关系

DNA barcode analysis: species identification and phylogenetic rela-tionships of the Carangidae family
YANG Long,LI Ang,LI Busu,WANG Huan,LIU Shufang,ZHUANG Zhimeng.DNA barcode analysis: species identification and phylogenetic rela-tionships of the Carangidae family[J].Journal of Fishery Sciences of China,2021,28(12):1523-1535.
Authors:YANG Long  LI Ang  LI Busu  WANG Huan  LIU Shufang  ZHUANG Zhimeng
Abstract:
Keywords:
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