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栉孔扇贝急性病毒性坏死病毒荧光定量PCR检测方法的建立和应用
引用本文:任伟成,王崇明,孙世春,蔡玉勇,李赟,于佐安.栉孔扇贝急性病毒性坏死病毒荧光定量PCR检测方法的建立和应用[J].中国水产科学,2009,4(4).
作者姓名:任伟成  王崇明  孙世春  蔡玉勇  李赟  于佐安
作者单位:1. 中国海洋大学水产学院,山东,青岛,266003;中国水产科学研究院黄海水产研究所,山东,青岛,266071
2. 中国水产科学研究院黄海水产研究所,山东,青岛,266071
3. 中国海洋大学水产学院,山东,青岛,266003
4. 辽宁省海洋水产科学研究院,辽宁,大连,116023
基金项目:国家863计划项目资助课题,公益性行业(农业)科研专项,山东省科技攻关项目 
摘    要:根据栉孔扇贝(Chlamys farreri)急性病毒性坏死病毒(Acute viral necmbiotic virus,AVNV)的基因序列,选择保守区段,应用Beacon Designer 7.0软件设计了一对能特异性扩增90 bp片段的引物和Taq Man探针,建立并完善了AVNV荧光定量聚合酶链式反应(Huorescent quantitative polymerase chain reaction,FQ-PCR)诊断方法.该方法在108~102病毒拷贝范围内有较好的线性关系,AVNV拷贝数(X)和循环数(G1)的相关关系为:IgX=-0.29C1+13.28(相关系数R2=0.998);检测AVNV的灵敏度为102拷贝;特异性实验表明只对AVNV基因组呈阳性反应.应用FQ-PCR对76份采自夏季发病期前后的栉孔扇贝样品进行检测,结果发现68份样品检测结果为阳性,阳性检出率为89.47%,高于普通PCR的阳性检出率(80.26%).研究结果表明,该方法快速、灵敏,特异、重复性良好且能实现AVNV的定量检测,对AVNV的快速诊断和分子流行病学的调查以及AVNV疫情监测具有重要意义.

关 键 词:栉孔扇贝  荧光定量聚合酶链式反应(FQ-PcR)  TaqMan探针
修稿时间:2009/7/21 0:00:00

Development and application of a FQ-PCR assay for detection of Chlamys farreri acute viral necrobiotic virus
REN Wei-cheng,WANG Chong-ming,SUN Shi-chun,CAI Yu-yong,LI Yun,YU Zuo-an.Development and application of a FQ-PCR assay for detection of Chlamys farreri acute viral necrobiotic virus[J].Journal of Fishery Sciences of China,2009,4(4).
Authors:REN Wei-cheng  WANG Chong-ming  SUN Shi-chun  CAI Yu-yong  LI Yun  YU Zuo-an
Abstract:
Keywords:AVNV  AVND
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