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3种鲳属鱼类线粒体COI 基因序列变异及系统进化
引用本文:张凤英,马凌波,施兆鸿,马春艳.3种鲳属鱼类线粒体COI 基因序列变异及系统进化[J].中国水产科学,2008,15(3):392-399.
作者姓名:张凤英  马凌波  施兆鸿  马春艳
作者单位:1. 中国水产科学研究院东海水产研究所,农业部海洋与河口渔业重点开放实验室,上海,200090;华东师范大学生命科学学院,上海,200063
2. 中国水产科学研究院东海水产研究所,农业部海洋与河口渔业重点开放实验室,上海,200090
基金项目:国家科技基础条件平台建设子项目 , 上海市科技兴农科技攻关项目 , 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项
摘    要:对采自东海的银鲳(Pampus argenteus)、翎鲳(P.punctatissimus)和中国鲳(P.chinensis)3种鲳属鱼类的线粒体COI基因序列片段进行扩增和序列测定,得到603bp的基因片段,编码201个氨基酸,碱基T、C、A、G平均含量分别为34.2%、22.3%、25.9%和17.6%。所得序列共定义12个单倍型,中国鲳只有1个单倍型,银鲳3个单倍型,翎鲳8个单倍型,在这12个单倍型中共检测到109个变异位点。3种鲳密码子的使用均存在明显的偏向性,且同义密码子使用偏向性高度一致。银鲳和中国鲳的遗传距离最大(0.165~0.168),与翎鲳的遗传距离次之(0.151~0.162),翎鲳和中国鲳的遗传距离最小(0.058~0.065)。由进化树可知,翎鲳和中国鲳的进化关系最近,它们与银鲳的进化关系较远,银鲳是最早形成的种。分子水平自然选择的检验结果表明,自然选择在银鲳和翎鲳线粒体COI基因差异形成过程中起一定的作用。本研究从分子水平研究中国东海海域鲳属鱼类的分类、遗传关系和系统进化,以其了解鲳属鱼类以及与鲳科之间的亲缘关系,又为鲳属鱼类保护生物学和系统进化提供分子生物学依据。中国水产科学,2008,15(3):392-399]

关 键 词:鲳属  线粒体COI基因  序列变异  系统进化  自然选择  鲳属鱼类  线粒体  基因  序列变异  系统进化  species  gene  mitochondrial  molecular  phylogeny  variation  水产科学  生物学依据  分子水平  保护生物学  亲缘关系  遗传关系  分类  东海海域  研究  作用
文章编号:1005-8737-(2008)03-0392-08
修稿时间:2007年7月24日

Sequence variation and molecular phylogeny of mitochondrial COI gene segments from three pomfret species
ZHANG Feng-ying,MA Ling-bo,SHI Zhao-hong,MA Chun-yan.Sequence variation and molecular phylogeny of mitochondrial COI gene segments from three pomfret species[J].Journal of Fishery Sciences of China,2008,15(3):392-399.
Authors:ZHANG Feng-ying  MA Ling-bo  SHI Zhao-hong  MA Chun-yan
Abstract:
Keywords:
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