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基于线粒体控制区序列的南海北部近岸鯻的遗传多样性
引用本文:薛丹,章群,郜星晨,宫亚运,曹艳.基于线粒体控制区序列的南海北部近岸鯻的遗传多样性[J].中国水产科学,2015,22(4):749-756.
作者姓名:薛丹  章群  郜星晨  宫亚运  曹艳
作者单位:暨南大学 水生生物研究中心, 广东 广州 510632
基金项目:国家自然科学基金资助项目(41071034); 中央高校基本科研业务费专项资金资助项目(21613105).
摘    要:80尾鯻(Therapon theraps)样本采自广东碣石、阳江,广西东兴,海南临高、陵水,测定其线粒体控制区951 bp序列,发现42个变异位点,60个单倍型。南海北部近岸鯻总体的单倍型多样性(0.986±0.007)和核苷酸多样性相对较低(0.009±0.000),其中陵水群体核苷酸多样性最高(0.010),碣石、阳江、东兴群体最低(0.008)。单倍型网络图与邻接树没有形成明显不同的谱系分支和地理聚群,表明不存在谱系结构和地理结构。大陆沿岸碣石、阳江和东兴群体间的遗传分化系数(Fst)为–0.017 5~0.008 9(P0.05),基因流(Nm)值为–14.54~27.84;海南岛临高和陵水群体间Fst为–0.046 0(P0.05),Nm为–5.68,表明大陆沿岸群体内部和海南岛群体内部都无明显分化;但海南岛与大陆群体间的Fst为0.061 6~0.135 3(P0.05),Nm为1.87~3.81。分子方差分析显示,大陆沿岸群体和海南岛群体间分化极显著(FCT=0.100 7,P=0.000 0),可能是受大陆与海南岛分离形成的琼州海峡,全年余流方向总趋势是由东向西,且强度较高的影响。南海北部近岸鯻可作为2个管理单位进行保护,建议优先保护陵水群体。单倍型简约性网络图呈非典型的星状分布,中性检验Fu’s Fs为显著负值且核苷酸不配对分析为单峰分布,表明历史上经历过种群扩张事件,推测扩张年代为晚更新世(3.62万年前),扩张后的有效群体大小约为扩张前的8.7×106倍,可能是受到海退缩减和海侵扩张的影响。

关 键 词:中国南海北部近岸        线粒体控制区    遗传变异
修稿时间:2015/7/29 0:00:00

Genetic variation of Therapon theraps in coastal waters of northern South China Sea based on mtDNA control region sequences
XUE Dan,ZHANG Qun,GAO Xingchen,GONG Yayun,CAO Yan.Genetic variation of Therapon theraps in coastal waters of northern South China Sea based on mtDNA control region sequences[J].Journal of Fishery Sciences of China,2015,22(4):749-756.
Authors:XUE Dan  ZHANG Qun  GAO Xingchen  GONG Yayun  CAO Yan
Institution:Institute of Hydrobiology, Jinan University, Guangzhou 510632, China
Abstract:
Keywords:coastal waters of northern South China Sea  Therapon theraps  mtDNA control region  genetic variation
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