| 坛紫菜“申福2号”的SSR分子标记 |
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| 引用本文： | 张庆杰,李琳,严兴洪.坛紫菜“申福2号”的SSR分子标记[J].中国水产科学,2013,20(4):859-868. |
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| 作者姓名： | 张庆杰 李琳 严兴洪 |
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| 作者单位： | 1. 上海海洋大学 水产与生命学院, 上海 201306;2. 上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室, 上海 201306 |
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| 基金项目： | 国家863计划项目(2012AA10A411); 国家自然科学基金资助项目(31072208); 农业部公益性专项(20093030); 国家农业科技成果转化基金项目(2011GB2C000005); 上海市科委重点科技攻关项目(10391901100); 国家海洋局公益专项(201105008, 201105023); 上海高校水产学一流学科建设项目. |
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| 摘 要： | 利用微卫星(SSR)分子标记技术, 对坛紫菜(Porphyra haitanensis)优良品系“申福2号”的丝状体和叶状体分别进行了特异性分子标记鉴定, 结果发现: 用9#引物(序列为F: TCACAATGGGTGATATGGC; R: CCACAT TTAAGTCCGACTCTG) 对“申福2号”丝状体的DNA进行扩增, 出现了能区别于其他14个品系(6个优良品系, 3个杂交品系, 5个野生品系)的特异性条带。用该引物对室内培养的“申福2号”叶状体的DNA进行扩增, 也均获得了与丝状体相同的特异性条带。此外, 用该引物分别对栽培在不同海区和不同时期采收的“申福2号”叶状体进行验证, 结果均出现了与丝状体相同的特异性条带。该特异性条带的DNA测序结果证实, 9#引物产生的SSR标记反映了微卫星DNA重复序列的变化。通过SSR Hunter软件搜索到了设计引物时的核心序列, 所得产物大小在预期长度范围内, 是特异性扩增。通过BLAST比对得知, 该序列在核酸数据库中没有同源序列, 是一个新序列。通过DNAMAN软件分析得知, “申福2号”、“申福1号”之间序列差异较小, 与坛紫菜霞浦野生种差异较大。这证实该标记反映的是种内品系间的差异, 可以用于种内品系鉴定。上述结果表明, 由9#引物扩增出的这一特异性条带可以认为是“申福2号”丝状体和叶状体的特异性标记, 可用于该品系的种质鉴定。
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| 关 键 词： | 坛紫菜 “申福2号” 微卫星DNA标记 品系鉴定 |
| 修稿时间： | 2013/7/18 0:00:00 |
Research on SSR marker of the SF-2 strain of Porphyra haitanensis Chang et Zheng (Bangiales, Rhodophyta) |
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| ZHANG Qingjie,LI Lin,YAN Xinghong.Research on SSR marker of the SF-2 strain of Porphyra haitanensis Chang et Zheng (Bangiales, Rhodophyta)[J].Journal of Fishery Sciences of China,2013,20(4):859-868. |
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| Authors: | ZHANG Qingjie LI Lin YAN Xinghong |
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| Institution: | College of Fisheries and Life Science, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Porphyra haitanensis SF-2 SSR marker strain identification |
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