| 长牡蛎糖原磷酸化酶基因SNPs与生长性状和糖原含量的相关性分析 |
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| 引用本文： | 刘思玮,李琪,于红,孔令锋.长牡蛎糖原磷酸化酶基因SNPs与生长性状和糖原含量的相关性分析[J].中国水产科学,2013,20(3):481-489. |
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| 作者姓名： | 刘思玮 李琪 于红 孔令锋 |
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| 作者单位： | 中国海洋大学 海水养殖教育部重点实验室, 山东 青岛 266003 |
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| 基金项目： | 国家973计划项目(2010CB126406); 国家863计划项目(2012AA10A405-6); 国家海洋公益性行业科研专项(200905020). |
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| 摘 要： | 为研究糖原磷酸化酶基因多态性与长牡蛎(Crassostrea gigas)生长和糖原含量的相关性,本研究对长牡蛎糖原磷酸化酶基因(Cg-GPH)编码区单核苷酸多态性(SNPs)与来自5个家系322个长牡蛎个体的生长性状(包括壳高、壳长、壳宽、总体质量以及软体部质量)和糖原含量进行了关联分析.结果表明,在1940 bp的长牡蛎糖原磷酸化酶基因中共检测到82个SNPs位点,其中63个SNPs位点位于外显子区域,1个SNPs位点位于5′-UTR区,18个SNPs位点位于3′-UTR区,编码区SNPs平均密度为1/25 bp;5个SNPs位点与生长性状存在显著相关(P<0.05),未检测到与糖原含量相关SNPs.根据以上5个SNPs位点共构建得到6个SNP单倍型,其中,Cg-GPH基因的H6(CTGAT)单倍型在总体质量性状方面均显著高于其他5种单倍型(P<0.05),表明H6单倍型可能是对长牡蛎体质量增加最有利的单倍型.研究结果为今后长牡蛎生长性状的遗传改良提供了基础资料.
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| 关 键 词： | 长牡蛎 糖原磷酸化酶基因 生长性状 糖原 SNPs |
| 修稿时间： | 2013/5/28 0:00:00 |
Single nucleotide polymorphisms in glycogen phosphorylase gene and their association with growth performance and glycogen content in Pacific oyster Crassostrea gigas |
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| LIU Siwei,LI Qi,YU Hong,KONG Lingfeng.Single nucleotide polymorphisms in glycogen phosphorylase gene and their association with growth performance and glycogen content in Pacific oyster Crassostrea gigas[J].Journal of Fishery Sciences of China,2013,20(3):481-489. |
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| Authors: | LIU Siwei LI Qi YU Hong KONG Lingfeng |
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| Institution: | Key Laboratory of Mariculture, Ministry of Education, OceanUniversity of China, Qingdao 266003, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Crassostrea gigas glycogen phosphorylase gene growth performance glycogen SNPs |
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