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中国对虾微卫星DNA引物的设计及筛选
引用本文:张天时,刘萍,孔杰,王清印.中国对虾微卫星DNA引物的设计及筛选[J].中国水产科学,2004,11(6):567-571.
作者姓名:张天时  刘萍  孔杰  王清印
作者单位:1. 中国水产科学研究院,黄海水产研究所,山东,青岛,266071;中国海洋大学,海洋生命学院,山东,青岛,266003
2. 中国水产科学研究院,黄海水产研究所,山东,青岛,266071
基金项目:国家自然科学基金项目(30271038);国家重点基础研究发展规划"973"课题(1999012009);国家"863"高技术课题(2003AA603021).
摘    要:根据建立的中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)部分基因组文库,对筛选的含微卫星DNA序列的克隆设计了28对引物,筛选出5对微卫星多态性引物,并用这5对引物对中国对虾的养殖群体20个个体进行了遗传多样性分析。在这5个微卫星位点中,虽然.RS0871位点是多态位点,但其等位基因数、杂合度和多态信息含量都比较低。其余4个微卫星位点可产生6~8个等位基因,等位基因的大小分布在142~364bp,基本上符合引物设计时理论产物长度。这些微卫星位点的期望杂合度的范围为0.7577~0.8064,表明它们都有较高的杂合度。仅有位点RS0956的观察杂合度与期望值有较大的出入,其他微卫星位点的这两值基本相符。有4个微卫星位点的PIC值较高,在0.7180~0.7709。因此,除RS0871位点以外的4个微卫星位点均可用于中国对虾种群遗传结构分析,这将为中国对虾品种选育、种系评估提供更多的微卫星DNA信息。

关 键 词:中国对虾  微卫星  基因组文库  遗传多样性
文章编号:1005-8737-(2004)06-0567-05
修稿时间:2003年12月16

Design and screening of microsatellite primers for Fenneropenaeus chinensis
Abstract:
Keywords:Fenneropenaeus chinensis  microsatellite  genomic libraries  genetic diversity
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