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哲罗鱼基因组微卫星富集文库的构建与分析
引用本文:佟广香,鲁翠云,匡友谊,梁利群,尹家胜,孙效文.哲罗鱼基因组微卫星富集文库的构建与分析[J].中国水产科学,2006,13(2):181-186.
作者姓名:佟广香  鲁翠云  匡友谊  梁利群  尹家胜  孙效文
作者单位:1. 中国水产科学研究院,黑龙江水产研究所,黑龙江,哈尔滨,150070;大连水产学院,辽宁,大连,116023
2. 中国水产科学研究院,黑龙江水产研究所,黑龙江,哈尔滨,150070
摘    要:采用磁珠富集法构建哲罗鱼(Hucho taimen Pallas)荩因组微卫星文库。哲罗鱼基因组DNA经MboⅠ限制性内切酶消化后,选取400-900bp的片段,用生物素标记的简单重复序列(ACA)15作探针与其杂交,杂交复合物结合到包被有链霉亲和素的磁珠上,获得目的片段,连接T载体克隆,构建基因组微卫旱富集文库。再用同位素标记的(ACA)15探针进行二次筛选,筛选出686个阳性克隆,阳性克隆率为35.94%。对其中140个阳性克隆进行测序,共获得149个微卫星序列,4个小卫星序列,其GenBank Accession Number为DQ110955~DQ121108。其中perfect(完美型)62个,占41.61%;imperfect(非完美型)92个,占61.74%;compound(混合型)5个,占3.36%,重复次数主要分布于6~45(81.21%),平均重复次数为32.5,这表明(ACA/TGT)。在哲罗鱼基因组DNA中含最非常丰富。本研究旨为从DNA水平上研究哲岁鱼种群结构、遗传多样性及目前群体现状等方面提供有效工具。

关 键 词:哲罗鱼  微卫星  磁珠富集
文章编号:1005-8737(2006)02-0181-06
收稿时间:2005-07-20
修稿时间:2005-10-19

Construction and identification on enriched microsatellite library from Hucho taimen Pallas genome
TONG Guang-xiang,LU Cui-yun,KUANG You-yi,LIANG Li-qun,YIN Jia-sheng,SUN Xiao-wen.Construction and identification on enriched microsatellite library from Hucho taimen Pallas genome[J].Journal of Fishery Sciences of China,2006,13(2):181-186.
Authors:TONG Guang-xiang  LU Cui-yun  KUANG You-yi  LIANG Li-qun  YIN Jia-sheng  SUN Xiao-wen
Institution:1. Heilongiiang River Fisherise Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Harbin 150070; 2. Dalian Fisheries Col lege, Dalian 116023, China
Abstract:
Keywords:Hucho taimen Pallas  microsatellite  enrichment with magnetic beads
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