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| 基于 Roche 454 GS FLX 的钝吻黄盖鲽(Pleuronectes yokohamae)微卫星标记的开发 | |
| 引用本文： | 潘婷,张岩,张辉,高天翔,肖永双,姜云荣.基于 Roche 454 GS FLX 的钝吻黄盖鲽(Pleuronectes yokohamae)微卫星标记的开发[J].海洋水产研究,2015(1). |
| 作者姓名： | 潘婷 张岩 张辉 高天翔 肖永双 姜云荣 |
| 作者单位： | 1. 上海海洋大学水产与生命学院 上海 201306; 农业部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所 青岛 266071 2. 农业部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所 青岛 266071; 上海海洋大学水产与生命学院 上海 201306 3. 中国科学院海洋研究所 青岛 266071 4. 中国海洋大学水产学院 青岛 266003 |
| 基金项目： | 国家科技基础条件平台项目(2006DKA30470-006)资助。 |
| 摘 要： | 利用 Roche 454 GS FLX 平台测序技术进行了钝吻黄盖鲽微卫星引物筛选，并采用聚类分析的方法对得到的5641个微卫星位点进行类比分析，得到247种多态性位点，其中完美型占52.22%，非完美型占20.24%，复合型占27.54%，(AC)n、(AG)n 两碱基重复类型的比例是44%，重复次数在10次以上的占总数的87.5%。随机选取11个位点的微卫星引物，采用5个野生个体，利用荧光标记和毛细管电泳进行多样性评价，4个位点偏离 Hardy-Weinberg 平衡，不同位点得到的等位基因范围为3?8，平均等位基因数为5.0。平均观望杂合度(Ho)、平均期望杂合度(He)及平均多态性信息含量(PIC)分别为0.588、0.788和0.670。结果表明，454 GS FLX 提供了一种直观、高效开发微卫星的方法。 |
| 关 键 词： | Roche 454 GS FLX 钝吻黄盖鲽 开发 微卫星标记 |
Microsatellite Loci Isolated by Roche 454 GS FLX in Pleuronectes yokohamae |
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| PAN Ting,ZHANG Yan,ZHANG Hui,GAO Tianxiang,XIAO Yongshuang,JIANG Yunrong.Microsatellite Loci Isolated by Roche 454 GS FLX in Pleuronectes yokohamae[J].Marine Fisheries Research,2015(1). | |
| Authors: | PAN Ting ZHANG Yan ZHANG Hui GAO Tianxiang XIAO Yongshuang JIANG Yunrong |
| Abstract: | |
| Keywords: | Roche 454 GS FLX Pleuronectes yokohamae Isolating Microsatellite markers |
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