| 滁州鲫(Carassius auratus)线粒体全基因组序列分析及系统进化 |
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| 引用本文： | 胡玉婷,胡 王,江 河,凌 俊,段国庆,潘庭双.滁州鲫(Carassius auratus)线粒体全基因组序列分析及系统进化[J].海洋水产研究,2015,36(5):63-70. |
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| 作者姓名： | 胡玉婷 胡 王 江 河 凌 俊 段国庆 潘庭双 |
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| 作者单位： | 安徽省农业科学院水产研究所 合肥 230031,安徽省农业科学院水产研究所 合肥 230031,安徽省农业科学院水产研究所 合肥 230031,安徽省农业科学院水产研究所 合肥 230031,安徽省农业科学院水产研究所 合肥 230031,安徽省农业科学院水产研究所 合肥 230031 |
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| 基金项目： | 安徽省财政专项资金项目(14D0508)、安徽省农业科学院成果推广项目(13E0504)和安徽省“115”产业创新团队(皖人才办[2009]2号)共同资助 |
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| 摘 要： | 为探讨天然三倍体滁州鲫的系统进化地位，采用直接测序法获得滁州鲫线粒体基因组。其序列全长为16581 bp，碱基组成为31.6% A、26.2% T、16.1% G和26.1% C，包括13个蛋白质基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因和1个非编码区，各基因的位置及组成与已公布的鲤科鱼类一致。除tRNA-Ser (AGY)外，其他21个tRNA的二级结构均具有典型的三叶草结构；13个蛋白编码基因中，除COⅠ起始密码子为GTG外，其余均以ATG为起始密码子；COⅡ、ND3、ND4和Cytb基因的终止密码子为不完整的T，其他9个基因均具有完整的终止密码子TAA或TAG。序列分析表明，滁州鲫与其他鲫属鱼类(方正银鲫A系和D系、鲫、淇河鲫、萍乡肉红鲫、黑鲫、日本白鲫和日本银鲫)在线粒体基因组上均具有较高的序列同源性(>94%)。以鲤(Cyprinus carpio haematopterus)为外类群，基于线粒体13个蛋白质基因的核苷酸与氨基酸序列构建上述鲫属鱼类的系统进化树，结果显示，滁州鲫与方正银鲫亲缘关系最近，与黑鲫最远。综合以上研究结果，认为滁州鲫应为银鲫亚种的一个地方种群。
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| 关 键 词： | 滁州鲫 线粒体基因组 系统进化分析 |
| 收稿时间： | 2014/11/3 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2014/12/3 0:00:00 |
Sequence and phylogenetic analysis of the complete mitochondrial genome of Chuzhou Crucian Carp (Carassius auratus) |
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| HU Yuting,HU Wang,JIANG He,LING Jun,DUAN Guoqing and PAN Tingshuang.Sequence and phylogenetic analysis of the complete mitochondrial genome of Chuzhou Crucian Carp (Carassius auratus)[J].Marine Fisheries Research,2015,36(5):63-70. |
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| Authors: | HU Yuting HU Wang JIANG He LING Jun DUAN Guoqing and PAN Tingshuang |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Chuzhou Crucian Carp (Carassius auratus) Mitochondrial genome |
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