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鱼菜共生模式中不同鱼类肠道微生物群落结构的比较
引用本文:李建柱,侯杰,张鹏飞,柳尧全,夏闰红,马徐发.鱼菜共生模式中不同鱼类肠道微生物群落结构的比较[J].南方水产科学,2016(6):42-50.
作者姓名:李建柱  侯杰  张鹏飞  柳尧全  夏闰红  马徐发
作者单位:华中农业大学,湖北武汉,430070
基金项目:国家科技支撑计划项目(2012BAD25B05),湖北省自然科学基金项目(2013CFA095)
摘    要:为研究鱼菜共生模式下不同鱼类肠道微生物的菌落结构,采用宏基因组学测序技术和生物信息学分析手段,构建了草鱼(Ctenopharyngodon idellus)、鲫(Carassius auratus)、鲢(Hypophthalmichthys molitrix)和鳙(Aristichthys nobilis)4种鲤科鱼类的肠道内含物等12个样品的16S rDNA测序克隆文库,分析了这4种鲤科鱼类肠道微生物的菌落组成和多样性。结果表明,鱼菜共生模式下不同鲤科鱼类肠道内含物微生物优势菌落的组成十分相似(P0.05,Kruskal-Wallis),优势微生物菌群均是鲸杆菌属(Cetobacterium)和梭状芽孢杆菌属(Clostridium)、拟杆菌属(Bacteroides)和芽孢杆菌属(Bacillus)等,其中鲸杆菌属和梭状芽孢杆菌属含量最丰富,且主要在非优势菌属之间具有显著差异(P0.05,Kruskal-Wallis),研究结果还表明食性不是造成不同食性鲤科鱼类肠道微生物菌落差异的唯一决定性因素。

关 键 词:鱼菜共生模式  鲤科  肠道微生物群落结构  食性  16S  rDNA

Comparative study of intestinal microbial community structure in different species of carp in aquaponics system
Abstract:
Keywords:aquaponics system  carp  intestinal microbial community structure  feeding habits  16S rDNA
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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