| 鲁氏耶尔森氏菌外膜蛋白ompF基因的分子克隆、生物信息学与免疫原性分析 |
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| 引用本文： | 王二龙,秦振阳,汪开毓,陈德芳,王均,贺扬.鲁氏耶尔森氏菌外膜蛋白ompF基因的分子克隆、生物信息学与免疫原性分析[J].南方水产科学,2016(3):24-34. |
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| 作者姓名： | 王二龙 秦振阳 汪开毓 陈德芳 王均 贺扬 |
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| 作者单位： | 1. 四川农业大学动物医学院,四川成都,611130;2. 四川农业大学动物医学院,四川成都611130;四川农业大学,动物疫病与人类健康四川省重点实验室,四川成都611130;3. 四川农业大学动物科技学院,四川成都,611130 |
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| 基金项目： | 教育部“长江学者和创新团队发展计划”创新团队项目(IRT0848)，四川省科技支撑计划项目(2014NZ0003) |
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| 摘 要： | 为筛选潜在的保护性抗原基因研制鲁氏耶尔森氏菌(Yersinia ruckeri)基因工程疫苗,实验利用特异性引物扩增分离自斑点叉尾(Ictalurus punctatus)的Y.ruckeri外膜蛋白omp F基因并对其进行分子克隆,应用相关软件和程序对其核苷酸及氨基酸序列进行生物信息学分析,并进行了omp F蛋白的表达和免疫原性检测。结果显示,omp F基因全长1 095 bp(Gen Bank登录号KP159420),包含一个编码364个氨基酸的完整开放阅读框,其氨基酸序列具有极高保守性,与Y.ruckeri外膜穿孔蛋白omp F(Gen Bank登录号ADK27779.1)亲缘关系最近,序列一致性为99.2%,进化树聚为一支;具有1个革兰氏阴性菌穿孔蛋白保守结构域,存在1个信号肽和1个跨膜区,是一种跨膜蛋白;具有12个与免疫相关的抗原决定簇区域。SDS-PAGE分析发现该蛋白主要以包涵体形式表达在沉淀,经Western-bolt显示omp F蛋白具有较好的免疫原性。以上结果表明omp F基因可作为Y.ruckeri基因工程疫苗的候选抗原基因。
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| 关 键 词： | 鲁氏耶尔森氏菌 外膜蛋白 ompF基因 分子克隆 生物信息学 免疫原性 |
Molecular cloning,bioinformatics and immunogenicity analyses of outer membrane protein ompF gene of Yersinia ruckeri |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Yersinia ruckeri outer membrane protein ompF gene molecular cloning bioinformatics immunogenicity |
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