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福建吊笼养殖仿刺参肠道菌群结构分析
引用本文:陆振,杨求华,林琪,黄瑞芳,何丽斌,葛辉,周宸,杜虹.福建吊笼养殖仿刺参肠道菌群结构分析[J].南方水产科学,2016(3):9-14.
作者姓名:陆振  杨求华  林琪  黄瑞芳  何丽斌  葛辉  周宸  杜虹
作者单位:1. 汕头大学生物系,广东汕头,515063;2. 福建省水产研究所,福建省海洋生物增养殖与高值化利用重点实验室,福建厦门361013
基金项目:福建省科技计划项目(2014R1003-1),福建省海洋高新产业发展专项(闽海洋高新[2015]29号)
摘    要:该研究基于Mi Seq高通量测序技术对福建霞浦海域海上吊笼养殖仿刺参(Apostichopus japonicus)肠道菌落结构进行分析。结果表明,仿刺参前肠(2H_1)、中肠(2H_2)和后肠(2H_3)测得的分类操作单元(OTUs)分别为124、116和78。3个组织样品菌群的物种丰度和优势菌种存在较大差别,其中前肠的物种丰度最高,为2.38,中肠其次,为2.22,后肠最低,为1.24。优势菌群方面,后肠的优势菌群为Formosa和乳球菌属(Lactococcus)(分别占细菌总数的87.38%和7.74%),而前肠和中肠的优势菌群均是乳球菌属和芽孢杆菌属(Bacillus),两者分别占前肠中细菌总数的59.68%和11.8%,在中肠中的占比分别为62.45%和12.07%。在重复性方面,后肠中发现的细菌在前肠和中肠中都有发现,而前肠和中肠分别发现6个和4个特有菌群。

关 键 词:仿刺参  吊笼养殖  肠道菌群  Miseq高通量测序

Bacterial component analysis of gut of Apostichopus japonicus cultured in suspension cage of Fujian
Abstract:
Keywords:Apostichopus japonicus  suspension cage  gut microbiota  Miseq high-throughput sequencing
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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