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南移池塘养殖仿刺参肠道菌群结构分析
引用本文:杨求华,陆振,林琪,黄瑞芳,何丽斌,葛辉,周宸,杜虹.南移池塘养殖仿刺参肠道菌群结构分析[J].福建水产,2016(3):192-201.
作者姓名:杨求华  陆振  林琪  黄瑞芳  何丽斌  葛辉  周宸  杜虹
作者单位:1. 福建省水产研究所,福建省海洋生物增养殖与高值化利用重点实验室,福建厦门361013;2. 汕头大学生物系,广东汕头,515063
基金项目:福建省科技计划项目(2014R1003-1),福建省海洋高新产业发展专项项目(闽海洋高新[2015]29号),闽台重要海洋生物资源高值化开发技术公共服务平台(2014FJPT01),福建重要海洋经济生物种质库与资源高效开发技术公共服务平台(14PZY017NF17)
摘    要:本文基于MiSeq高通量测序技术对南移福建池塘养殖仿刺参(Apostichopus japonicus)肠道菌落结构进行分析。结果表明,仿刺参前肠(1 C_1)、中肠(1 C_2)和后肠(1C_3)测得的分类操作单元(OTUs)分别为424、444和414;三组样品的菌群物种丰度没有较大差别,但优势菌种存在较大差异;优势菌群方面,后肠的优势菌群为Haliea属和乳球菌属(Lactococcus)(分别占后肠总菌数的11.97%和10.37%),而前肠和中肠的优势菌群均是乳球菌属和芽孢杆菌属(Bacillus),两者在前肠菌落中的占比分别为27.91%和6.08%,在中肠中的占比分别为33.24%和6.97%。在重复性方面,三组样品的菌落组成都有重叠,重叠率为74.35%,其中前肠与中肠相似度较高,菌株种类有90%以上重叠。本文研究为仿刺参肠道益生菌的开发利用提供基础资料。

关 键 词:MiSeq高通量测序  仿刺参  池塘养殖  肠道菌群

Bacterial component analysis of the gut of South Apostichopus japonicus cultured in pond
Abstract:
Keywords:
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