南移池塘养殖仿刺参肠道菌群结构分析 |
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引用本文: | 杨求华,陆振,林琪,黄瑞芳,何丽斌,葛辉,周宸,杜虹. 南移池塘养殖仿刺参肠道菌群结构分析[J]. 福建水产, 2016, 0(3): 192-201. DOI: 10.14012/j.cnki.fjsc.2016.03.003 |
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作者姓名: | 杨求华 陆振 林琪 黄瑞芳 何丽斌 葛辉 周宸 杜虹 |
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作者单位: | 1. 福建省水产研究所,福建省海洋生物增养殖与高值化利用重点实验室,福建厦门361013;2. 汕头大学生物系,广东汕头,515063 |
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基金项目: | 福建省科技计划项目(2014R1003-1),福建省海洋高新产业发展专项项目(闽海洋高新[2015]29号),闽台重要海洋生物资源高值化开发技术公共服务平台(2014FJPT01),福建重要海洋经济生物种质库与资源高效开发技术公共服务平台(14PZY017NF17) |
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摘 要: | 本文基于MiSeq高通量测序技术对南移福建池塘养殖仿刺参(Apostichopus japonicus)肠道菌落结构进行分析。结果表明,仿刺参前肠(1 C_1)、中肠(1 C_2)和后肠(1C_3)测得的分类操作单元(OTUs)分别为424、444和414;三组样品的菌群物种丰度没有较大差别,但优势菌种存在较大差异;优势菌群方面,后肠的优势菌群为Haliea属和乳球菌属(Lactococcus)(分别占后肠总菌数的11.97%和10.37%),而前肠和中肠的优势菌群均是乳球菌属和芽孢杆菌属(Bacillus),两者在前肠菌落中的占比分别为27.91%和6.08%,在中肠中的占比分别为33.24%和6.97%。在重复性方面,三组样品的菌落组成都有重叠,重叠率为74.35%,其中前肠与中肠相似度较高,菌株种类有90%以上重叠。本文研究为仿刺参肠道益生菌的开发利用提供基础资料。
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关 键 词: | MiSeq高通量测序 仿刺参 池塘养殖 肠道菌群 |
Bacterial component analysis of the gut of South Apostichopus japonicus cultured in pond |
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Abstract: | |
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