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基于mt COI、Cyt b、D-loop序列的南方多鳞鱚群体遗传结构分析
引用本文:彭敏,肖珊,姚久祥,潘传燕,李旻,高雪梅,冯鹏霏,李满园,曾地刚,朱威霖,杨春玲,蒋伟明,陈秀荔.基于mt COI、Cyt b、D-loop序列的南方多鳞鱚群体遗传结构分析[J].水生态学杂志,2023,44(1):108-116.
作者姓名:彭敏  肖珊  姚久祥  潘传燕  李旻  高雪梅  冯鹏霏  李满园  曾地刚  朱威霖  杨春玲  蒋伟明  陈秀荔
作者单位:广西水产科学研究院 广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室,广西 南宁 530021;;广西水产引育种中心,广西 南宁 530031;(1.广西水产科学研究院 广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室,广西 南宁 530021;
基金项目:广西创新驱动发展专项(桂科AA17204088-2)
摘    要:基于线粒体COI、Cyt b、D-loop基因序列对福建厦门(XM)、广东阳江(YJ)、海南海口(HK)和广西北海(BH)的4个多鳞鱚(Sillago sihama)群体进行遗传结构分析。经PCR扩增和测序获得4个多鳞鱚群体195条线粒体COI + Cyt b + D-loop片段序列。结果表明,单倍型多样性指数(Hd)为0.88266~0.98785,核苷酸多样性指数(π)为0.00098~0.00257,整体Hd与π分别为 0.92784 和 0.00158。遗传分化系数(Fst)和基因流(Nm)分别为0.00075~0.14888和2.85851~333.0833。分子方差分析(AMOVA)结果显示,分组间群体内变异比例分别占93.33%、86.57%和94.49%,主要变异均来自群体内。综上,基于COI、Cyt b和D-loop的分析结果,厦门群体和北海、海口、阳江群体间存在中等程度的遗传分化,可作为两个管理保护单位进行保护。本研究为促进中国南方沿海多鳞鱚资源的可持续利用及遗传多样性保护提供参考依据。

关 键 词:多鳞鱚  线粒体DNA  遗传结构  遗传多样性
收稿时间:2021/5/17 0:00:00
修稿时间:2021/7/13 0:00:00

Genetic Structure of Four Sillago sihama Populations in Southern China Based on Mitochondrial Sequences
PENG Min,XIAO Shan,YAO Jiu-xiang,PAN Chuan-yan,LI Min,GAO Xue-mei,FENG Peng-fei,LI Man-yuan,ZENG Di-gang,ZHU Wei-lin,YANG Chun-ling,JIANG Wei-ming,CHEN Xiu-li.Genetic Structure of Four Sillago sihama Populations in Southern China Based on Mitochondrial Sequences[J].Journal of Hydroecology,2023,44(1):108-116.
Authors:PENG Min  XIAO Shan  YAO Jiu-xiang  PAN Chuan-yan  LI Min  GAO Xue-mei  FENG Peng-fei  LI Man-yuan  ZENG Di-gang  ZHU Wei-lin  YANG Chun-ling  JIANG Wei-ming  CHEN Xiu-li
Abstract:
Keywords:Sillago sihama  mitochondrial DNA  genetic structure  genetic diversity
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