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2种海洋饵料微藻藻际环境的细菌多样性研究
引用本文:黄振华,陈星星,柯爱英,曾国权,吴越.2种海洋饵料微藻藻际环境的细菌多样性研究[J].水生态学杂志,2018,39(1):44-49.
作者姓名:黄振华  陈星星  柯爱英  曾国权  吴越
作者单位:浙江省海洋水产养殖研究所,浙江省海洋水产养殖研究所,浙江省海洋水产养殖研究所,浙江省海洋水产养殖研究所,浙江省海洋水产养殖研究所
基金项目:浙江省科技厅项目,省级重点实验室开放基金项目
摘    要:选取对数生长期的海洋饵料微藻——角毛藻(Chaetoceros sp.)和扁藻(Platymonas sp.)藻液,经无菌混合纤维素酯膜抽滤,获得游离和粘附的藻际细菌,并提取基因组DNA进行16S r DNA高通量测序,测序区间为16S r DNA的V3~V4可变区,测序结果经过数据质控获得有效序列数分别为44 222和40 721,用Uclust v1.1.579对序列进行OTU聚类,获得有效OTU数分别为3 747和3 809;用RDP classifier进行物种注释,分析藻际环境的细菌多样性。结果表明,2种微藻的藻际细菌主要分布于变形菌门(Proteobacteria)。角毛藻藻际细菌优势种群主要分布于γ-变形菌纲(34.3%)和α-变形菌纲(16.3%),扁藻藻际细菌优势种群主要分布于γ-变形菌纲(36.9%)、α-变形菌纲(17.7%)和β-变形菌纲(11.4%)。细菌群落Alpha多样性指数表明,角毛藻覆盖率为96.4%,香农指数为6.28,ACE指数为7 247.64,Chao1指数为6 046.91;扁藻覆盖率为98.0%,香农指数为5.99,ACE指数为7 166.06,Chao1指数为6 172.99。2藻种的藻际细菌群落内菌种均匀性和多样性相近。

关 键 词:海洋饵料微藻  藻际环境  16SrDNA  高通量测序
收稿时间:2016/8/9 0:00:00
修稿时间:2017/9/13 0:00:00

Bacterial Diversity in the Phycosphere of Two Marine Bait-Microalgae
HUANG Zhen-hu,CHEN Xing-xing,KE Ai-ying,ZENG Guo-quan and WU Yue.Bacterial Diversity in the Phycosphere of Two Marine Bait-Microalgae[J].Journal of Hydroecology,2018,39(1):44-49.
Authors:HUANG Zhen-hu  CHEN Xing-xing  KE Ai-ying  ZENG Guo-quan and WU Yue
Institution:Zhejiang Mariculture Research Institute,Zhejiang Key Lab of Exploitation and Preservation of Coastal Bio-Resource,Zhejiang Mariculture Research Institute,Zhejiang Key Lab of Exploitation and Preservation of Coastal Bio-Resource,Zhejiang Mariculture Research Institute,Zhejiang Key Lab of Exploitation and Preservation of Coastal Bio-Resource,Zhejiang Mariculture Research Institute,Zhejiang Key Lab of Exploitation and Preservation of Coastal Bio-Resource,Zhejiang Mariculture Research Institute,Zhejiang Key Lab of Exploitation and Preservation of Coastal Bio-Resource
Abstract:
Keywords:marine bait-microalgae  phycosphere  16SrDNA  high-throughput sequencing
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