| COⅠ和16S rRNA基因在高原裂腹鱼物种鉴定中的应用 |
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| 引用本文： | 产久林,姜华鹏,刘一萌,胡星星,王丛丛,许强华.COⅠ和16S rRNA基因在高原裂腹鱼物种鉴定中的应用[J].水生态学杂志,2015,36(4):98-104. |
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| 作者姓名： | 产久林 姜华鹏 刘一萌 胡星星 王丛丛 许强华 |
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| 作者单位： | 上海海洋大学海洋科学学院,上海海洋大学海洋科学学院,上海海洋大学,上海海洋大学,上海海洋大学,上海海洋大学海洋科学学院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金重点项目（31130049）；教育部科学技术研究项目（213013A）；上海市教委科研创新项目曙光计划（13SG51）；上海市教委水产学一流学科项目。 |
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| 摘 要： | 针对裂腹鱼种类繁多、种间形态学差异不明显的特点，利用分子标记对高原裂腹鱼进行准确的物种鉴定具有重要价值。对采集的60尾高原裂腹鱼进行了COⅠ和16S rRNA基因的部分序列测定，并通过GenBank数据库进行鱼种鉴定；运用邻接法（NJ）构建系统发育树，对实验鱼进行群系划分；通过DNASP软件分析比较实验鱼COⅠ和16S rRNA基因的序列变异；依据MEGA 6.0的Kimura-2-parameter模型计算实验鱼的种内遗传距离和种间遗传距离，并对COⅠ和16S rRNA基因在高原裂腹鱼物种鉴定中的适用性进行探讨。结果表明，采集的样本包含3属、5种裂腹鱼，分别为尖裸鲤属的尖裸鲤（Oxygymnocypris stewartii）、裸鲤属的软刺裸鲤（Gymnocypris dobula）、裂腹鱼属的拉萨裂腹鱼（Schizothorax waltoni）、巨须裂腹鱼（Schizothorax macropogon）和异齿裂腹鱼（Schizothorax oconnori）。在COⅠ基因构建的系统发育树中，5种高原裂腹鱼均形成独立的一支，而16S rRNA基因不能准确地对裂腹鱼属的3个鱼种实现区分。研究显示，5种高原裂腹鱼COⅠ基因核苷酸的变异水平（Pi）和单倍型多样性指数（Hd）均高于16S rRNA基因；COⅠ基因计算得到实验鱼种间遗传距离和种内遗传距离平均值分别为0.025和0.002，种内和种间的最大遗传差异约为13倍；16S rRNA基因得出结果为0.026和0.005，而种内和种间的最大遗传差异约为6倍。综合COⅠ和16S rRNA基因能有效鉴定高原裂腹鱼物种，而在单个基因的选择上，COⅠ基因具有更高的适用性。
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| 关 键 词： | COⅠ 16S rRNA 高原裂腹鱼 物种鉴定 |
| 收稿时间： | 2/9/2015 12:00:00 AM |
| 修稿时间： | 2015/9/21 0:00:00 |
Application of COⅠ and 16S rRNA Gene for Identification of Tibetan Plateau Schizothorax Species |
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| CHAN Jiu-lin,JIANG Hua-peng,LIU Yi-meng,HU Xing-xing,WANG Cong-cong and XU Qiang-hua.Application of COⅠ and 16S rRNA Gene for Identification of Tibetan Plateau Schizothorax Species[J].Journal of Hydroecology,2015,36(4):98-104. |
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| Authors: | CHAN Jiu-lin JIANG Hua-peng LIU Yi-meng HU Xing-xing WANG Cong-cong and XU Qiang-hua |
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| Institution: | Shanghai Ocean University,SHANGHAI OCEAN UNIVERSITY,SHANGHAI OCEAN UNIVERSITY,SHANGHAI OCEAN UNIVERSITY,SHANGHAI OCEAN UNIVERSITY,SHANGHAI OCEAN UNIVERSITY |
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