| 中华鳖体表和体内菌群多样性分析 |
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| 引用本文： | 胡广洲,李登峰,苏秀榕,李太武,贺静静.中华鳖体表和体内菌群多样性分析[J].水产科学,2010,29(7). |
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| 作者姓名： | 胡广洲 李登峰 苏秀榕 李太武 贺静静 |
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| 作者单位： | 应用海洋生物技术教育部重点实验室,宁波大学,生命科学与生物工程学院,浙江,宁波,315211 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目，宁波大学学科项目，宁波大学人才项目，浙江省自然科学基金人才培养项目 |
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| 摘 要： | 采用16S rDNA分析方法,分别提取中华鳖体表和体内细菌总DNA,以之为模板进行PCR扩增获得细菌16S rDNA基因片段,并构建16S rDNA克隆文库.从2个文库中分别随机选取100个重组克隆子,抽提重组质粒,用Hae Ⅲ和MspⅠ限制性内切酶进行酶切,获得酶切指纹图谱,从每种图谱随机挑选克隆子测序,获得其16S rDNA部分序列,构建了系统进化树.在中华鳖体表和体内细菌克隆文库中分别包含13种和10种RFLP谱型,分别挑选了70个和60个克隆子进行测序.结果表明,中华鳖体表和体内文库克隆子分别归为15类和11类OTU,体表和体内菌群多样性较强,优势细菌类群分别为拟杆菌和变形菌,并在文库中检测到了几株益生菌和条件致病菌.
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| 关 键 词： | 中华鳖 细菌多样性 |
Phylogenetic Diversity of External and Internal Bacteria Associated with Soft-shelled Turtle(Trionyx sinensis) |
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| HU Guang-zhou,LI Deng-feng,SU Xiu-rong,LI Tai-wu,HE Jing-jing.Phylogenetic Diversity of External and Internal Bacteria Associated with Soft-shelled Turtle(Trionyx sinensis)[J].Fisheries Science,2010,29(7). |
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| Authors: | HU Guang-zhou LI Deng-feng SU Xiu-rong LI Tai-wu HE Jing-jing |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | 16S rDNA RFLP |
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