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基于COⅠ序列绒螯蟹属DNA条形码和遗传多样性研究
引用本文:徐洁,王晓梅,李晶晶,陈池,李转转,张玲颖.基于COⅠ序列绒螯蟹属DNA条形码和遗传多样性研究[J].水产科学,2017(4):480-487.
作者姓名:徐洁  王晓梅  李晶晶  陈池  李转转  张玲颖
作者单位:1. 天津农学院 水产学院,天津市水产生态及养殖重点实验室,天津 300384;2. 天津市水生动物疫病预防控制中心,天津,300402
基金项目:天津市水产局科技发展计划项目(J2013-21)
摘    要:对绒螯蟹属的中华绒螯蟹如东和七里海群体、日本绒螯蟹、合浦绒螯蟹及狭颚绒螯蟹共80条线粒体COⅠ片段进行扩增和测序,并与GenBank中绒螯蟹属的台湾绒螯蟹2条和近方蟹属的绒毛近方蟹19条COⅠ基因序列进行联配分析。结果显示,101条序列包含44种单倍型,序列组成表现明显的碱基偏倚性。中华绒螯蟹如东、七里海群体与日本绒螯蟹间的遗传距离分别为1.210%和1.078%,明显低于COⅠ基因DNA条形码鉴别种的遗传距离为2%的阈值,表明中华绒螯蟹和日本绒螯蟹为同一物种;而合浦绒螯蟹与中华绒螯蟹如东和七里海群体及与日本绒螯蟹的遗传距离分别为4.823%、5.101%以及5.011%,明显大于2%的鉴别阈值,说明合浦绒螯蟹为独立的种。以绒毛近方蟹为外群,基于群体内及群体间的遗传距离构建的邻接树显示,中华绒螯蟹与日本绒螯蟹聚在一起,合浦绒螯蟹则聚成单系。本文测序的5个群体除狭颚绒螯蟹外,其余均具有遗传多样性,单倍型多样性为0.593±0.144~0.779±0.068,核苷酸多样性为0.00156~0.01336;此外,中华绒螯蟹如东群体与日本绒螯蟹、合浦绒螯蟹和中华绒螯蟹七里海群体分别共享单倍型H1、H2和H3,说明这些蟹类可能有种质资源混杂或是遗传污染的现象。

关 键 词:绒螯蟹  COⅠ基因  DNA条形码  物种鉴定  遗传多样性

DNA Barcoding and Genetic Diversity in Genus Eriocheir Based on COⅠ Gene Sequences
XU Jie,WANG Xiaomei,LI Jingjing,CHEN Chi,LI Zhuanzhuan,ZHANG Lingying.DNA Barcoding and Genetic Diversity in Genus Eriocheir Based on COⅠ Gene Sequences[J].Fisheries Science,2017(4):480-487.
Authors:XU Jie  WANG Xiaomei  LI Jingjing  CHEN Chi  LI Zhuanzhuan  ZHANG Lingying
Abstract:
Keywords:
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