基于Cytb和D-Loop的日本囊对虾遗传多样性分析 |
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引用本文: | 杜景豪,王伟峰,陈秀荔,侯春秀,王焕岭.基于Cytb和D-Loop的日本囊对虾遗传多样性分析[J].水产科学,2020,39(4). |
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作者姓名: | 杜景豪 王伟峰 陈秀荔 侯春秀 王焕岭 |
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作者单位: | 华中农业大学 水产学院,湖北 武汉 430070;广西壮族自治区水产科学研究院,广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室,广西 南宁 530021 |
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基金项目: | 广西壮族自治区科技重大专项 |
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摘 要: | 2018年8月至2019年3月,在浙江舟山、福建福州、福建厦门、广西北海和广东湛江5个近海水域,各采集约20尾日本囊对虾,取其腹部第六腹节肌肉,利用线粒体细胞色素b基因和DNA控制区分析方法,研究日本囊对虾这5个地理群体的种群遗传结构及变异情况,探明我国日本囊对虾种质资源现状。Cytb和D-Loop序列分析发现,5个群体中A+T含量分别为60.65%和82.54%,明显高于C+G含量(39.35%和17.46%)。在Cytb和D-Loop序列中分别检测到了76和75个简约信息位点,55和78个单倍型。Cytb和D-Loop单倍型多态性分别为0.969和0.995,核苷酸多态性分别为0.033和0.036,群体内遗传距离分别为0.004~0.022和0.005~0.017,群体间遗传距离分别为0.007~0.068和0.012~0.075。分子方差分析显示,群体间变异是变异的主要来源,占总变异的70.01%和74.39%。单倍型系统发育树显示,北海和湛江群体聚为一支,其他3个群体聚为另外一支,同一单系间又有不同程度的分化。种群历史动态显示种群相对稳定,近期未曾经历过瓶颈效应和明显扩张。综上所述,5个日本囊对虾群体区域分化较为明显,具有较高的遗传多样性,呈现出较高的单倍型和核苷酸多态性。
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关 键 词: | 日本囊对虾 Cytb D-Loop 遗传结构 遗传多样性 |
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