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基于DNA条形码对浙南岛屿日本花棘石鳖的遗传特征分析
引用本文:吴晓雯,张华伟,余海,彭欣,张永普.基于DNA条形码对浙南岛屿日本花棘石鳖的遗传特征分析[J].海洋渔业,2018(3).
作者姓名:吴晓雯  张华伟  余海  彭欣  张永普
作者单位:温州大学生命与环境科学学院;浙江省海洋水产养殖研究所;苍南县水产研究所
摘    要:采用COⅠ、16S rRNA两种分子标记对中国浙江南部沿海岛屿岩相潮间带日本花棘石鳖(Liolophura japonica)13个群体遗传特征和亲缘关系进行了探讨。结果显示:COⅠ基因片段长度为675 bp,16S rRNA基因长度为517 bp,A+T比例分别为62.5%和64.9%。COⅠ基因总多态位点数为41个,单倍型多样性指数0.847,核苷酸多态性指数为0.006 01,平均核苷酸差异数为4.057 8;16S rRNA基因的总多态位点数为9个,单倍型多样性指数0.665,核苷酸多态性指数为0.001 69,平均核苷酸差异数为0.871 2。以Acanthopleura brevispinosa和A.granulata为外群构建了ML和BI系统发育树,其拓扑结构显示,基于COⅠ基因的日本花棘石鳖形成2个分支;基于16S rRNA基因的日本花棘石鳖群体仅聚合为一支。不同地理群体单倍型散乱分布,没有出现明显的地理结构和遗传谱系结构,表明各岛屿的日本花棘石鳖为近期分化并存在基因交流。

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