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中国近海黑鲷线粒体DNA控制区序列多态性分析
引用本文:龚金波,苏天凤,夏军红,龚世园,江世贵.中国近海黑鲷线粒体DNA控制区序列多态性分析[J].南方水产,2006,2(4):24-30.
作者姓名:龚金波  苏天凤  夏军红  龚世园  江世贵
作者单位:1. 华中农业大学水产学院,湖北,武汉,430070;中国水产科学研究院南海水产研究所,广东,广州,510030
2. 中国水产科学研究院南海水产研究所,广东,广州,510030
3. 华中农业大学水产学院,湖北,武汉,430070
基金项目:国家科技基础条件平台工作项目(2004DKA30470),广东省科技计划项目(2005B60301006)
摘    要:采用聚合酶链式反应(PCR)和直接测序的方法,测定了广西北海、广东深圳和山东青岛3个地理群体共72尾黑鲷(Acanthopagrusschlegeli)线粒体Dloop第一高变区5′端547~549bp序列,以探讨黑鲷种群的遗传变异。分析结果表明:72条序列T、C、A、G4种核苷酸的平均含量分别为30.8%、21.8%、36.3%、11.0%。共检测到55个变异位点,其中转换位点32个,颠换位点19个,缺失/颠换位点1个,插入/颠换位点3个。72个个体具有51种单倍型(haplotype),单倍型比率为70.8%,黑鲷线粒体Dloop控制区表现出较为丰富的核苷酸多态性。对其所有单倍型依据序列距离使用NJ法构建的亲缘关系树并无明显的系谱分支,没有显示出明显的地理分布族群,说明黑鲷线粒体DNA控制区第一高变区序列无法用于黑鲷种群的鉴别。

关 键 词:黑鲷  DNA序列  线粒体控制区  多态性
文章编号:1673-2227-(2006)04-0024-07
修稿时间:2005年12月22

Polymorphism study of the mitochondrial DNA D-loop control region sequences from black porgy Acanthopagrus schlegeli,in the costal waters of China
GONG Jinbo,SU Tianfeng,XIA Junhong,GONG Shiyuan,JIANG Shigui.Polymorphism study of the mitochondrial DNA D-loop control region sequences from black porgy Acanthopagrus schlegeli,in the costal waters of China[J].South China Fisheries Science,2006,2(4):24-30.
Authors:GONG Jinbo  SU Tianfeng  XIA Junhong  GONG Shiyuan  JIANG Shigui
Abstract:
Keywords:Acanthopagrus schlegeli  black porgy  mitochondrial DNA  D-loop  genetic polymorphism
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
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