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草鱼α-淀粉酶基因5'侧翼序列克隆与分析
引用本文:朱书礼,李新辉,杨计平,李跃飞,李捷,帅方敏,李琳.草鱼α-淀粉酶基因5'侧翼序列克隆与分析[J].南方水产,2014(5).
作者姓名:朱书礼  李新辉  杨计平  李跃飞  李捷  帅方敏  李琳
作者单位:1. 中国水产科学研究院珠江水产研究所,广东 广州510380; 大连海洋大学,辽宁 大连116023
2. 中国水产科学研究院珠江水产研究所,广东 广州,510380
基金项目:公益性行业(农业)科研专项经费项目(200903048-05);广西区自然科学基金重大项目(2013GXNSFEA053003);科技部社会公益项目
摘    要:应用PCR和Genome Walking技术克隆获得长度为168 bp的草鱼( Ctenopharyngodon idellus)α-淀粉酶基因外显子Ⅰ序列和2063 bp的5'侧翼序列。将草鱼α-淀粉酶基因外显子Ⅰ序列与已知几种鱼类α-淀粉酶基因外显子Ⅰ序列比对,相似度为68%~86%。将草鱼α-淀粉酶基因5'侧翼序列进行生物信息学分析,确定了其转录起始区域及转录起始位点( TSS);在TSS上游30 bp处有1个TATA-box,-58 bp处有CCAAT-box;在5'侧翼序列中还发现有GATA-1、OCT-1、GR、HNF-3、AP1和SP1等转录因子结合位点。草鱼α-淀粉酶基因5'侧翼序列的克隆,为进一步研究不同食性鱼类α-淀粉酶基因侧翼序列的差异、鱼类α-淀粉酶基因的表达、功能及调控机理奠定基础。

关 键 词:草鱼  α-淀粉酶基因  Genome  Walking  5'侧翼序

Cloning and analysis of 5' flanking sequence of α-amylase gene from Ctenopharyngodon idellus
ZHU Shuli,LI Xinhui,YANG Jiping,LI Yuefei,LI Jie,SHUAI Fangmin,LI Lin.Cloning and analysis of 5' flanking sequence of α-amylase gene from Ctenopharyngodon idellus[J].South China Fisheries Science,2014(5).
Authors:ZHU Shuli  LI Xinhui  YANG Jiping  LI Yuefei  LI Jie  SHUAI Fangmin  LI Lin
Abstract:
Keywords:Ctenopharyngodon idellus  α-amylase gene  Genome Walking  5'flanking sequence
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