| 应用细胞色素b序列对鲷科鱼类进行种类鉴定的可行性研究 |
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| 引用本文： | 夏军红.应用细胞色素b序列对鲷科鱼类进行种类鉴定的可行性研究[J].南方水产,2007,3(1):37-43. |
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| 作者姓名： | 夏军红 |
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| 作者单位： | 中国水产科学研究院南海水产研究所,广东,广州,510300 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(30500376) |
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| 摘 要： | 从NCBI分子生物学数据库下载鲷科鱼类10属12种共24条Cytb序列,通过序列比对最终获得1070bp的共有序列。其中,共检测到675个单态位点,393个变异位点,2个未知位点,没有检测到插入缺失。每个种具有的种特征性位点数为4到24个不等,平均约为12.42个。种间遗传距离分布范围为0.105±0.010(SE)到0.220±0.017(SE),均值为0.180±0.0231(SD),而种内遗传距离要小于或等于0.018±0.004(SE),均值为0.007±0.006(SD),因此,种间遗传距离要远远大于种内遗传距离。系统发育分析发现,来源于同一种内的2条序列都被聚为一个类群。以上分析显示不同鲷科种类能够通过Cytb序列较好的进行区分,据此提出,当2个鲷科鱼类个体基于以上Cytb序列计算得到的遗传距离如小于0.018时可以初步判断属于同一种,大于0.105则为不同种。研究为鲷科鱼类的分子种类鉴定提供了部分基础资料。
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| 关 键 词： | 鲷科 细胞色素b 种类鉴定 |
| 文章编号： | 1673-2227-(2007)01-0037-07 |
| 修稿时间： | 2006年8月15日 |
Identification standard of Sparid species based on cytochrome b sequences |
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| XIA Junhong.Identification standard of Sparid species based on cytochrome b sequences[J].South China Fisheries Science,2007,3(1):37-43. |
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| Authors: | XIA Junhong |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Sparidae cytochrome b species identification |
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