| 中国、日本和澳大利亚珍珠贝的ITS 2序列特征分析 |
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| 引用本文： | 喻达辉,李有宁,吴开畅.中国、日本和澳大利亚珍珠贝的ITS 2序列特征分析[J].南方水产,2005,1(2):1-6. |
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| 作者姓名： | 喻达辉 李有宁 吴开畅 |
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| 作者单位： | 中国水产科学研究院南海水产研究所,广东,广州,510300 |
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| 基金项目： | 国家“863”重大项目(2002AA603022)，广东省科技计划项目(2002B2150101)，广东省自然科学基金项目(037148) |
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| 摘 要： | 对中国、日本和澳大利亚的珍珠贝核糖体DNA第二内部转录间隔子(ITS2)的序列特征进行了分析。PCR扩增产物包括5.8S基因部分序列、ITS2基因和28S基因部分序列。去除引物序列后5.8S基因片段长64bp,ITS2长230～237bp,28S基因片段长249bp。共分析了16个基因型的序列特征,结果表明,5.8S和28S基因片段高度保守,仅28S有1个碱基位点突变;而ITS2变异大,237个比对位点中有20个位点发生突变,其中12个位点为缺失/插入突变,4个简约信息位点。在碱基组成中,5.8S和28S的GC含量(58.1%～59.4%)高于AT含量,也高于ITS2的GC含量(51.3%～52.0%),ITS2的GC含量与AT含量相差不大。碱基组成中5.8S的A碱基含量较低,28S的T碱基含量较低,存在较大的碱基偏倚性。3个地理群体内和群体间的遗传距离都很小(0.010～0.013),且相互重叠。从基因型数据看,3个群体既有各自独立的基因型,也有共享基因型。但从序列的碱基变异数据看,3个群体没有各自独有的突变位点。上述结果表明,3个地理群体既具有丰富的遗传多样性,又具有高度的遗传一致性,即亲缘关系近,可能存在基因交流,或者分化时间不长。丰富的遗传多样性有利于合浦珠母贝的遗传选育。
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| 关 键 词： | 合浦珠母贝 内部转录间隔子 DNA序列分析 地理亲缘关系 |
| 文章编号： | 1673-2227-(2005)02-0001-06 |
| 修稿时间： | 2005年4月11日 |
Analysis on sequence variation of ITS 2 rDNA in Pinctada fucata from China, Japan and Australia |
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| YU Da-hui,LI You-ning,Wu Kai-chang.Analysis on sequence variation of ITS 2 rDNA in Pinctada fucata from China, Japan and Australia[J].South China Fisheries Science,2005,1(2):1-6. |
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| Authors: | YU Da-hui LI You-ning Wu Kai-chang |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Pinctada fucata ITS 2 DNA sequence analysis phylogeography |
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