| 锦鲤疱疹病毒ORF72基因克隆及结构功能分析 |
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| 引用本文： | 王世会,贾智英,李池陶,孙志鹏,石连玉.锦鲤疱疹病毒ORF72基因克隆及结构功能分析[J].水产学杂志,2016(3):9-15. |
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| 作者姓名： | 王世会 贾智英 李池陶 孙志鹏 石连玉 |
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| 作者单位： | 中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,黑龙江哈尔滨,150070 |
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| 基金项目： | 国家科技支撑计划(2012BAD26B01)，现代农业产业技术体系建设专项资金资助(CARS-46-02)，中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(HSY201401) |
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| 摘 要： | 于辽宁丹东采集感染锦鲤疱疹病毒的活鲤Cyprinus carpio样品,经DNA提取、PCR扩增、重组质粒构建步骤成功克隆锦鲤疱疹病毒ORF72基因,并利用生物信息学软件分析ORF72蛋白结构与功能,构建系统进化树。结果显示:ORF72基因开放阅读框共1113bp,编码蛋白由370个氨基酸组成,理论相对分子质量为40.5KD;ORF72蛋白主要由α螺旋、β折叠、无规则卷曲3种二级结构组成;N端35个氨基酸序列为信号肽序列。跨膜结构分析表明:ORF72蛋白无跨膜区,保守结构域预测表明ORF72含有一个保守结构域,抗原表位分析表明,抗原性较好。结构预测显示:ORF72氨基酸序列存在2个潜在的N-糖基化位点、1个潜在的O-糖基化位点、19个潜在的磷酸化位点。系统进化树分析发现,其与锦鲤疱疹病毒美国株、以色列株属同一分支。
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| 关 键 词： | 锦鲤疱疹病毒 ORF72基因 结构功能分析 |
Cloning and Functional Analysis of ORF72 Gene in Koi Herpes Virus |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Koi herpes virus ORF72 gene structure and function analysis |
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